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aquamarineqp铜虫 (初入文坛)
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Miseq测一段编码氨基酸的序列,测序结果里有好多内部终止子(internal stop codon)已有1人参与
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用 Illumina Miseq 对pcr 序列测序,这段序列是一段己知的编码氨基酸的序列,但分析时发现有好多序列里有内部终止子,这是由于PCR扩增错误?测序错误?还是其他的什么原因引起的, 这样有内部终止子的序列在分析时要不要去掉啊?去掉了会不会影响多样性分析? ???????TQ--YLFIVVVAVNSTL---LTINAGDYIFYTDWAWKSF--VIFSISQSTMLAVGAVYYLLFTGVPGTATYYATIMTIYTWVAK--GAWFAL-GYPYDFVA ??WLRRTTH--YLFIVVVAVNSTL---LTINAGDYIFYTDWAWTSF--VIFSISQSTMLAVGAVY*LLFTGVPGTATYYATIMTIYTWLAK--GAWLAL-GYPYDFV? MVWLRRTTH--YLFIVVVAVNSTL---LTINAGDYIFYTDWAWTSF--VIFSISQSTMLAVGAVYYLLFTGVPGTATYYAIIRTIHTWVAT--GVWFAL-GYPYDFV? ??WLRRTTH--YLFIVVVAVNSTL---LTITAGDYIFYTDWAWTSF--VIFSISQSTMLAVGAVYSLLFTGVPGTATYYATIMTIYTWVAK--GAWFAL-*YPYDFV? |
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2楼2016-03-27 17:33:54
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但还是想看一下有没有别的解释