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aquamarineqp铜虫 (初入文坛)
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Miseq测一段编码氨基酸的序列，测序结果里有好多内部终止子(internal stop codon)已有1人参与
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用 Illumina Miseq 对pcr 序列测序，这段序列是一段己知的编码氨基酸的序列，但分析时发现有好多序列里有内部终止子，这是由于PCR扩增错误？测序错误？还是其他的什么原因引起的， 这样有内部终止子的序列在分析时要不要去掉啊？去掉了会不会影响多样性分析？ ???????TQ--YLFIVVVAVNSTL---LTINAGDYIFYTDWAWKSF--VIFSISQSTMLAVGAVYYLLFTGVPGTATYYATIMTIYTWVAK--GAWFAL-GYPYDFVA ??WLRRTTH--YLFIVVVAVNSTL---LTINAGDYIFYTDWAWTSF--VIFSISQSTMLAVGAVY*LLFTGVPGTATYYATIMTIYTWLAK--GAWLAL-GYPYDFV? MVWLRRTTH--YLFIVVVAVNSTL---LTINAGDYIFYTDWAWTSF--VIFSISQSTMLAVGAVYYLLFTGVPGTATYYAIIRTIHTWVAT--GVWFAL-GYPYDFV? ??WLRRTTH--YLFIVVVAVNSTL---LTITAGDYIFYTDWAWTSF--VIFSISQSTMLAVGAVYSLLFTGVPGTATYYATIMTIYTWVAK--GAWFAL-*YPYDFV? |
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atlanticwi
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2楼2016-03-27 17:33:54