| 查看: 10099 | 回复: 32 | |||
| 【奖励】 本帖被评价17次，作者kgoing增加金币 12.8 个 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[资源]
如何在天河二号上安装Material Studio软件
|
|||
|
做过模拟计算的同仁，应该对于Material Studio软件比较熟悉，尤其是该软件友好的界面，是优秀的前处理以及后处理软件之一。但该软件常用的模块Castep/Dmol/Forcite的并行效率并不高，即使对于linux版（更不用说Windows版），我想诸君都很少用到百核以上。因此，今天跟大家分享一下如何利用超算（目前运行最快的天河二号为例）的分布式系统，突破并行核数以及内存的限制。 如果大家有该软件版权的话，不妨根据附件的安装文档，自己尝试安装。MS常用的版本包括60/70/80，安装以及使用的方法则是大同小异，我已经将安装文档、脚本（针对天河二号的SLUERM系统）以及相关的文件（支持高速网的库文件）添加到附件中，大家可以结合安装文档的内容去使用其他附件。同时建议大家安装成功以后一定要进行正确性测试，用自己熟悉的算例结果去比对。 在此，需要分享的一个经验的是，虽然天河二号的收费方式是以一个结点为计算单元（一个结点24核，即用1核和用24个核是一样的收费方式），但并不一定每个算例用满一个结点CPU物理核的性能最好（举个例子：任务量一定，过多CPU物理核的参与，会把时间浪费在协调上），如果不太清楚自己算例的情况，可以做扩展性测试，从1、2、4、8、16...核数一直往上测执行时间，在时间曲线的拐点附近寻找最优核数。 PS：有问题的虫友，请给我留言，如果相关内容有问题，我会及时更新。。 |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : MS_lib.tar.gz
- 附件 2 : 如何在天河二号上安装MS.pdf
- 附件 3 : sub_script.tar.gz
2016-03-17 17:48:13, 28.33 M
2016-03-17 17:48:21, 404.59 K
2016-03-21 15:06:26, 713 bytes
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 NWCHEM |
» 猜你喜欢
0702一志愿吉大B区求调剂 本科期间发表一篇Sci
已经有2人回复
-
070200求调剂，一志愿某211，288分
已经有18人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有208人回复
-
法国博士后职位
已经有0人回复
-
重庆交大26年硕士生招生拟调剂通知已出！欢迎加入机器视觉与3D光学成像课题组。
已经有0人回复
-
**
已经有1人回复
-
0702一志愿吉大B区求调剂 本科期间发表一篇Sci
已经有3人回复
-
基底STO,薄膜SRO，XRD里面的振荡，是laue震荡还是kiessig振荡? 怎么判断？
已经有0人回复
-
B区学生调剂-兰州交通大学材料科学与工程学院
已经有2人回复
19楼2018-02-26 22:06:32
2楼2016-03-23 20:41:41
3楼2016-04-08 19:13:00
6楼2016-04-30 23:13:12
简单回复
sunpixel4楼
2016-04-09 07:02
回复
2016-04-09 20:53
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
书虫呆呆7楼
2016-05-20 14:28
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
xiaozhigang11楼
2017-01-16 10:15
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
saphy12楼
2017-03-13 18:36
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
hdlghzb14楼
2017-03-16 14:42
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
