24小时热门版块排行榜    

查看: 1162  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

丫丫兮兮1991

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助求助,大家好,我想问问Amber11可以在自己电脑上进行分子动力学模拟嘛? 已有2人参与

求助求助,大家好,我想问问Amber11可以在自己电脑上进行分子动力学模拟嘛?我是Windows7的电脑。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

丫丫兮兮1991

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wbf3ng at 2016-03-20 05:50:43
可以,不过有两点:1.要自行编译安装;2.会比较慢;

那如果我要算I型胶原蛋白的热稳定分子动力学的话大概要多久算完一个
3楼2016-03-20 12:38:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

wbf3ng

金虫 (小有名气)

可以,不过有两点:1.要自行编译安装;2.会比较慢;

发自小木虫Android客户端
2楼2016-03-20 05:50:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

awaken2013

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by 丫丫兮兮1991 at 2016-03-20 12:38:36
那如果我要算I型胶原蛋白的热稳定分子动力学的话大概要多久算完一个...

看你模拟体系多大 你也没给出配置,也没衡量要跑多久。热稳定性不是你跑1 2个重复就可以的 温度梯度还要摸索。
如果是按100ns来说 少则一个星期 多则半个月,一个重复。
就我自己论文来说 模拟了一年 还不是很满意。

发自小木虫IOS客户端
4楼2016-03-21 23:48:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

克罗米虎

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

首先Amber只能在linux上运行,你要么换系统要么装虚拟机。其次AMBER的GPU版本速度比较快,如果你有nvidia的支持CUDA的显卡的话速度还可以接受,没有的话,只用CPU版本就可以基本放弃了,8核以下基本做不出来啥。
专业的计算模拟服务:http://www.wecomput.com
5楼2016-03-22 20:06:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 02:21 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +11 Tide man 2026-08-10 12/600 2026-08-15 02:12 by home3163
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 01:28 by 4wMiSEwB6436
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 7lpolszZVXgi 2026-08-14 4/200 2026-08-15 01:08 by 4wMiSEwB6436
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-15 00:16 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-14 22:32 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +5 Ldrop2023 2026-08-13 5/250 2026-08-14 18:48 by ssxclkj
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
信息提示
请填处理意见