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求问多肽与核酸模拟结合的软件！ 已有2人参与
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 我做的方向是多肽和核酸的结合，核酸的结构可以下到，但是多肽结构是没有的。请问哪些软件可以预测多肽结构？哪些软件可以对结合做动力学模拟？求问~ |
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2楼2016-03-18 16:25:57
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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其实预期结果想准确还是比较难，尽管现在软件比较多。除非预先知道多肽的结果，可以首先用伸展构想的多肽结构试试，放在模拟过程中多肽结构会变化。可以查文献看看是否有相关软件，比如 http://genesilico.pl/NPDock。 相应文章见http://nar.oxfordjournals.org/co ... /14/nar.gkv493.full 当然还有其他docking软件可以，见上述文献。 如果docking结构符合你的要求，很多动力学软件都可以用，amber，gromacs，namd等等。 |
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学术黄3楼2016-03-21 18:38:43
4楼2016-03-21 18:55:01
5楼2016-03-21 20:46:52
6楼2016-03-22 09:34:35
7楼2016-03-22 18:15:54