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fix nvt 体系为何会越来越大？ 已有1人参与
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做lammps模拟，大概是金属板上面一层水，取的是p p fm边界 用nvt跑平衡的时候，系统的体积会越来越大，总会有几个水分子跑得很远很远，这是正常情况吗？ 照理说nvt的话体积应该恒定啊~~ 我看的文献里并没有提到这种现象，是我的边界条件错误了还是漏了些什么东西呢？ 参考的文献是Martin Fitzner, Gabriele C. Sosso, Stephen J. Cox, et al. JACS.137,13658(2015) in文件： echo screen units real newton on dimension 3 boundary p p fm atom_style atomic region box block -30.00 30.00 -30.00 30.00 0.00 70.00 units box create_box 2 box lattice bcc 2.8665 region metel block INF INF INF INF 0.00 4.00 units lattice create_atoms 1 region metel lattice sc 3.15 region water block INF INF INF INF 13.50 48.50 units box create_atoms 2 region water mass 1 55.845 mass 2 18.01528 pair_style hybrid lj/cut 7.53 sw pair_coeff * * sw mW.sw NULL HOO pair_coeff 1 2 lj/cut 1.00 2.34 pair_coeff 1 1 none group M type 1 group W type 2 timestep 10 fix 1 M setforce 0.00 0.00 0.00 dump min all atom 100 min.lammpstrj minimize 1.0e-5 1.0e-6 10000 100000 undump min thermo 100 dump tmp all atom 10000 tmp1.lammpstrj fix 2 all nvt temp 290.0 290.0 500 tchain 10 run 1000000 undump tmp1 |
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3楼2016-03-21 09:18:27
alundilong
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5楼2016-04-13 10:35:38
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