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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 建模问题
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黑曼小巴

新虫 (小有名气)

[求助] 建模问题 已有1人参与

我想建个比较简单的模型，用硅晶体建个4*4*4的超晶胞，然后把其中一些硅原子取代成别的原子，可以直接用lammps的命令建立模型吗，我是用MS建的模型，但是转换成data文件后总感觉不对，而且有键角等力场的参数缺失。运行后也不对
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1楼 2016-03-15 20:10:01
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alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
推荐使用moltemplate
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2楼2016-03-15 20:30:45
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黑曼小巴

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-03-15 20:30:45
推荐使用moltemplate

谢谢回复，问个很简单的问题，都说lammps的manual里可以查文献，查力场参数，可是我没有找到文献的链接，可以给个吗？
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3楼2016-03-17 14:11:02
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issp-hao

银虫 (正式写手)
Lammps建模功能有限，只是跑分子动力学的，建模还得自己写小程序解决

发自小木虫Android客户端
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4楼2016-03-17 18:56:45
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黑曼小巴

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by issp-hao at 2016-03-17 18:56:45
Lammps建模功能有限，只是跑分子动力学的，建模还得自己写小程序解决

我知道，我是通过MS建模的，然后转换到lammps里，可是转换过后有些力场参数缺失，需要查补一些参数。
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5楼2016-03-17 20:25:17
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alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
黑曼小巴: 金币+20, ★★★很有帮助 2016-03-18 09:36:02
引用回帖:
3楼: Originally posted by 黑曼小巴 at 2016-03-17 00:11:02
谢谢回复，问个很简单的问题，都说lammps的manual里可以查文献，查力场参数，可是我没有找到文献的链接，可以给个吗？...

不知道你说的是在线版本的手册吗？
建议楼主再仔细看看：每张网页最底下有文件提供的（并不所有网页都提供的），并且，那个文献不是链接。
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6楼2016-03-17 22:37:32
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黑曼小巴

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by alundilong at 2016-03-17 22:37:32
不知道你说的是在线版本的手册吗？
建议楼主再仔细看看：每张网页最底下有文件提供的（并不所有网页都提供的），并且，那个文献不是链接。...

谢谢啦
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7楼2016-03-18 09:36:57
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黑曼小巴

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-03-15 20:30:45
推荐使用moltemplate

你好，我看了moltemplate的manual，这个moltemplate是要自己设置键角参数吗，有没有使用心得呀，感激不尽
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8楼2016-03-22 10:48:01
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alundilong

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 黑曼小巴 at 2016-03-21 20:48:01
你好，我看了moltemplate的manual，这个moltemplate是要自己设置键角参数吗，有没有使用心得呀，感激不尽...

看看给的例子就会了
找moltemplate官网的例子
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9楼2016-03-22 11:24:39
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黑曼小巴

新虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by alundilong at 2016-03-22 11:24:39
看看给的例子就会了
找moltemplate官网的例子...

你好，我看了一些moltemplate例子，在他们lt file中，都是设置好的键角参数呀，还是可以用moltemplate的命令来生成这些参数呢？
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10楼2016-03-24 14:36:21
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