24小时热门版块排行榜    

查看: 1921  |  回复: 11

黑曼小巴

新虫 (小有名气)

[求助] 建模问题 已有1人参与

我想建个比较简单的模型,用硅晶体建个4*4*4的超晶胞,然后把其中一些硅原子取代成别的原子,可以直接用lammps的命令建立模型吗,我是用MS建的模型,但是转换成data文件后总感觉不对,而且有键角等力场的参数缺失。运行后也不对
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
推荐使用moltemplate
2楼2016-03-15 20:30:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黑曼小巴

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-03-15 20:30:45
推荐使用moltemplate

谢谢回复,问个很简单的问题,都说lammps的manual里可以查文献,查力场参数,可是我没有找到文献的链接,可以给个吗?
3楼2016-03-17 14:11:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

issp-hao

银虫 (正式写手)

Lammps建模功能有限,只是跑分子动力学的,建模还得自己写小程序解决

发自小木虫Android客户端
4楼2016-03-17 18:56:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黑曼小巴

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by issp-hao at 2016-03-17 18:56:45
Lammps建模功能有限,只是跑分子动力学的,建模还得自己写小程序解决

我知道,我是通过MS建模的,然后转换到lammps里,可是转换过后有些力场参数缺失,需要查补一些参数。
5楼2016-03-17 20:25:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
黑曼小巴: 金币+20, ★★★很有帮助 2016-03-18 09:36:02
引用回帖:
3楼: Originally posted by 黑曼小巴 at 2016-03-17 00:11:02
谢谢回复,问个很简单的问题,都说lammps的manual里可以查文献,查力场参数,可是我没有找到文献的链接,可以给个吗?...

不知道你说的是在线版本的手册吗?
建议楼主再仔细看看:每张网页最底下有文件提供的(并不所有网页都提供的),并且,那个文献不是链接。
6楼2016-03-17 22:37:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黑曼小巴

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by alundilong at 2016-03-17 22:37:32
不知道你说的是在线版本的手册吗?
建议楼主再仔细看看:每张网页最底下有文件提供的(并不所有网页都提供的),并且,那个文献不是链接。...

谢谢啦
7楼2016-03-18 09:36:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黑曼小巴

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-03-15 20:30:45
推荐使用moltemplate

你好,我看了moltemplate的manual,这个moltemplate是要自己设置键角参数吗,有没有使用心得呀,感激不尽
8楼2016-03-22 10:48:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alundilong

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 黑曼小巴 at 2016-03-21 20:48:01
你好,我看了moltemplate的manual,这个moltemplate是要自己设置键角参数吗,有没有使用心得呀,感激不尽...

看看给的例子就会了
找moltemplate官网的例子
9楼2016-03-22 11:24:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黑曼小巴

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by alundilong at 2016-03-22 11:24:39
看看给的例子就会了
找moltemplate官网的例子...

你好,我看了一些moltemplate例子,在他们lt file中,都是设置好的键角参数呀,还是可以用moltemplate的命令来生成这些参数呢?
10楼2016-03-24 14:36:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 黑曼小巴 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 3/150 2026-08-29 03:03 by gy1nBQXYQJqL
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +3 gouxfjh 2026-08-28 3/150 2026-08-29 01:01 by jurkat.1640
[基金申请] 国自然评审意见 +11 wangmingqi 2026-08-28 15/750 2026-08-29 00:17 by fangyl2005
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
请填处理意见