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alundilong

木虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by 黑曼小巴 at 2016-03-24 00:36:21
你好,我看了一些moltemplate例子,在他们lt file中,都是设置好的键角参数呀,还是可以用moltemplate的命令来生成这些参数呢?...

moltemplate自由度非常大,你可以选择下面两种方式来建模:
1. 指定力场的,比如oplsaa的, 那么你需要指定的就是,'Data Atom'和‘Bond List’ 部分,其他自动生成(角,二面角)。具体例子刻在example中找到。
2. 所有参数都自己给。
这种方式的话,就得自己指定原子类型,坐标,成键,成角,成二面角了。具体例子也可以在example中找见。
11楼2016-03-24 22:42:08
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黑曼小巴

新虫 (小有名气)

引用回帖:
11楼: Originally posted by alundilong at 2016-03-24 22:42:08
moltemplate自由度非常大,你可以选择下面两种方式来建模:
1. 指定力场的,比如oplsaa的, 那么你需要指定的就是,'Data Atom'和‘Bond List’ 部分,其他自动生成(角,二面角)。具体例子刻在example中找到。
...

多谢~
12楼2016-03-25 09:31:53
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