24小时热门版块排行榜    

查看: 1774  |  回复: 11

alundilong

木虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by 黑曼小巴 at 2016-03-24 00:36:21
你好,我看了一些moltemplate例子,在他们lt file中,都是设置好的键角参数呀,还是可以用moltemplate的命令来生成这些参数呢?...

moltemplate自由度非常大,你可以选择下面两种方式来建模:
1. 指定力场的,比如oplsaa的, 那么你需要指定的就是,'Data Atom'和‘Bond List’ 部分,其他自动生成(角,二面角)。具体例子刻在example中找到。
2. 所有参数都自己给。
这种方式的话,就得自己指定原子类型,坐标,成键,成角,成二面角了。具体例子也可以在example中找见。
11楼2016-03-24 22:42:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黑曼小巴

新虫 (小有名气)

引用回帖:
11楼: Originally posted by alundilong at 2016-03-24 22:42:08
moltemplate自由度非常大,你可以选择下面两种方式来建模:
1. 指定力场的,比如oplsaa的, 那么你需要指定的就是,'Data Atom'和‘Bond List’ 部分,其他自动生成(角,二面角)。具体例子刻在example中找到。
...

多谢~
12楼2016-03-25 09:31:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 黑曼小巴 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 288求调剂 +14 于海海海海 2026-03-19 14/700 2026-03-19 19:40 by maocaozhuxi
[考研] 一志愿中国海洋大学,生物学,301分,求调剂 +5 1孙悟空 2026-03-17 5/250 2026-03-19 18:03 by zcl123
[考研] 271材料工程求调剂 +6 .6lL 2026-03-18 6/300 2026-03-19 15:41 by haoshis
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +8 薛云鹏 2026-03-13 8/400 2026-03-19 15:36 by haoshis
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 0817调剂 +3 没有答案_ 2026-03-14 3/150 2026-03-19 09:51 by Xu de nuo
[考研] 一志愿华中科技大学,080502,354分求调剂 +4 守候夕阳CF 2026-03-18 4/200 2026-03-18 22:16 by li123456789.
[考研] 330求调剂 +3 小材化本科 2026-03-18 3/150 2026-03-18 21:55 by 无懈可击111
[考研] 297求调剂 +8 戏精丹丹丹 2026-03-17 8/400 2026-03-18 14:30 by laoshidan
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +7 ZY-05 2026-03-13 8/400 2026-03-18 14:13 by 007_lilei
[考研] 0703化学求调剂 总分331 +3 ZY-05 2026-03-13 3/150 2026-03-18 10:58 by macy2011
[考研] 0703化学调剂 +3 妮妮ninicgb 2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:29 by macy2011
[考研] 考研化学学硕调剂,一志愿985 +4 张vvvv 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:15 by ruiyingmiao
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林,给自己招师弟中~ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[考研] 一志愿,福州大学材料专硕339分求调剂 +3 木子momo青争 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
[考研] [导师推荐]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[考研] 0703一志愿211 285分求调剂 +5 ly3471z 2026-03-13 5/250 2026-03-16 16:16 by 哦哦123
信息提示
请填处理意见