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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP在深圳超算上如何做计算前 ，截断能，K点，晶格常数等测试
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jackjiejl

木虫 (小有名气)

[求助] VASP在深圳超算上如何做计算前 ，截断能，K点，晶格常数等测试 已有3人参与

#!/bin/sh

rm WAVECAR
for i in 400 450 500 550 600 650 700 750 800
do
cat > INCAR << !
SYSTEM=job_name
ENCUT=$i
ISTART=0; ICHARG=2
ISMEAR=-5
GGA=91
VOSKOWN=1
PREC=High
!
echo "ENCUT= $i eV"; time vasp
E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f\n",$5}'`
echo $i $E >> comment
done
这是在网上下载的脚本，大概应该是侯博士的教程里面的，但是我不清楚这个脚本如何使用，我是在深圳超算上使用，需要对这个脚本添加什么呢，自己对程序这块不懂，希望大家能指点一下，
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加油
1楼 2016-03-15 09:37:05
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obaica
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2楼2016-03-15 10:25:24
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cahndengbin

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你要看下深圳超算系统里的一些命令。
例如我是在天河超算，就要把倒数第四行的time vasp改成
yhrun -N 1 -n 12 -p TH_NET1 vasp
其中-N表示指定节点数，-n表示指定进程数，-p表示在哪个分区上算。
然后提交任务的时候用
yhbatch -N 1 -n 12 -p TH_NET1 ./run_encut.sh
大致是这个意思，你要仔细去看深圳超算系统的用户手册，那样比在小木虫上问清楚多了。
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3楼2016-03-15 18:50:48
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jackjiejl

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cahndengbin at 2016-03-15 18:50:48
你要看下深圳超算系统里的一些命令。
例如我是在天河超算，就要把倒数第四行的time vasp改成
yhrun -N 1 -n 12 -p TH_NET1 vasp
其中-N表示指定节点数，-n表示指定进程数，-p表示在哪个分区上算。
然后提交任务 ...

谢谢您的回复，我刚看了深圳的使用手册，改了相应的部分，但是还是有点问题，您能吧这个完整的脚本贴上来看看么？ 谢谢您
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加油
4楼2016-03-16 11:11:13
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hh1025

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

内容已删除
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5楼2016-03-24 12:24:50
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

这个例子只是一个测试截断能的脚本，可以用类似的脚本来测试截断能，k点，还有晶格参数，等等。在这个脚本后面需要加入你的vasp绝对运行路径，然后在提交任务脚本里指向这个测试脚本，输出不同的测试值对应的能量，选择合适的截断能。可以模仿一个例子来试一下

发自小木虫IOS客户端
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work doesn't work without play
6楼2016-03-24 20:52:33
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luzihen

金虫 (正式写手)
内容已删除
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7楼2016-03-25 15:01:20
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