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深圳超算lsf问题
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最近在深圳超算中心yw区用VASP算东西的时候经常出任务实际上已经完全跑完了，就是所有的输出都表示计算完成了，可是任务还是挂在排队系统上面，显示还在运行，这样浪费了好多机时，他们用的是lsf系统，和pbs感觉没有很大区别，有没有什么办法让任务出错自动掉下来的，感觉他们就是在任务不能正常结束的感觉。 我的lsf脚本 #!/bin/sh APP_NAME=intelw_exc NP=36 NP_PER_NODE=12 RUN="RAW" VASP=/home-yw/users/nsyw102/bin/vasp-5.3.5 source /lsfhome/env/intel-12.1.sh source /lsfhome/env/openmpi-1.6.5-intel.sh date >time touch WAVECAR PCDAT IBZKPT XDATCAR OSZICAR CONTCAR CHG PROCAR OUTCAR EIGENVAL DOSCAR CHGCAR vasp.out vasp.err sleep 5 mpirun -np $NP $VASP >vasp.out 2>vasp.err date >time 望大神解脱 |
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