24小时热门版块排行榜    

查看: 2372  |  回复: 33
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

kingjazz23

金虫 (小有名气)

[求助] CRISPR/Cas系列问题 已有1人参与

您们好,今年研一下学期老板打算做CRISPR/Cas,叫我查查问题,我们打算做酵母的CRISPR/Cas,看了几篇文献,有些问题不是很懂,所以想问问你们:
(1)在paper中经常会看到一个a premature stop codon,想问问他有什么作用,一般看到都是用研究人员在PAM的位置引入的,不太清楚他们的意图是什么?
(2)经常在paper中看到gRNA cassette和plasmid,我知道plasmid是质粒的意思,而前面那个cassette不太清楚是什么意思,在DiCarlo的一篇文献中,他提到了两种gRNA的表达方法,一个是gRNA PCR cassette还有一个是gRNA plasmid,这两个到底有什么区别?
(3)经常在文章中出现的target sequence是存在于gRNA上的那段识别目标DNA的序列还是指含有PAM序列那段序列?
(4)文章中有时候会出现的tRNA是指tracrRNA吗?
(5)同样是在DiCarlo那篇文献中,其中有一句话是Donor DNA was designed to recombine within the gRNA CAN1.Y genomic target using homology arms to the site,
想问问这句话是什么意思?Donor DNA不是应该与基因组序列配对吗?通过同源臂进行修复,达到替换的效果,这里为什么说是与gRNA结合呢?
(6)文献中常常出现的oligonucleotide是指Donor DNA吗?

以上这些就是本人一些不太理解的地方,希望各路大神帮忙解决一下,谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Bioexperixgs

新虫 (正式写手)

引用回帖:
32楼: Originally posted by kingjazz23 at 2016-03-15 10:06:54
不是N20吗?S12+N8
...

最主要的是临近的8个必须完全匹配

发自小木虫Android客户端
33楼2016-03-15 21:20:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 34 个回答

王继楼马

新虫 (小有名气)

已关注这个问题,目前课题涉及CRISPR-CAS9,原理还是懂,先推荐楼主看中文的说明再去看英文的文献,会好很多。因为很多概念你只有中文才能理解透彻。抱歉先关注,这两天闲下来的时候再共同讨论。
2楼2016-03-11 20:52:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ken19860823

木虫 (正式写手)

1.蛋白质翻译起始于atg,终止于三个终止子。如果前面的序列提前突变成终止子就是premature stop codon了。。2.一个表达单元叫cassette,包含启动子cds

发自小木虫Android客户端
做基因修饰的老菜鸡
3楼2016-03-11 21:06:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happykings

木虫 (正式写手)

4楼2016-03-11 21:09:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085601求调剂总分293英一数二 +3 钢铁大炮 2026-03-24 3/150 2026-03-24 22:03 by bingxueer79
[材料工程] 一志愿C9材料与化工专业总分300求调剂 +4 曼111 2026-03-24 5/250 2026-03-24 15:44 by 星空星月
[考研] 321求调剂 +4 Ymlll 2026-03-24 4/200 2026-03-24 14:44 by sprinining
[考研] 279分求调剂 一志愿211 +18 chaojifeixia 2026-03-19 20/1000 2026-03-24 10:34 by dolphin_ycj
[基金申请] 请教下大家 2026年国家基金申请是双盲审吗? +3 lishucheng1 2026-03-22 5/250 2026-03-24 08:22 by gltch
[考研] 269求调剂 +4 我想读研11 2026-03-23 4/200 2026-03-23 21:25 by pswait
[考研] 336求调剂 +4 收到VS 2026-03-20 4/200 2026-03-23 19:02 by macy2011
[考研] 一志愿南京理工大学085701资源与环境302分求调剂 +5 葵梓卫队 2026-03-18 7/350 2026-03-23 16:26 by lingjue
[考研] 352求调剂 +3 大米饭! 2026-03-22 3/150 2026-03-22 23:28 by king123!
[考研] 317求调剂 +12 申子申申 2026-03-19 18/900 2026-03-22 22:23 by luoyongfeng
[考研] 289求调剂 +7 怀瑾握瑜l 2026-03-20 7/350 2026-03-22 15:57 by ColorlessPI
[考研] 求调剂 +3 白QF 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:12 by zhukairuo
[考研] 求调剂 +6 Mqqqqqq 2026-03-19 6/300 2026-03-21 08:04 by JourneyLucky
[考研] 南京大学化学376求调剂 +3 hisfailed 2026-03-19 6/300 2026-03-20 23:43 by hisfailed
[考研] 一志愿南昌大学,327分,材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +5 @taotao 2026-03-20 5/250 2026-03-20 20:16 by JourneyLucky
[考研] 0856调剂,是学校就去 +8 sllhht 2026-03-19 9/450 2026-03-20 14:25 by 无懈可击111
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +5 ioodiiij 2026-03-17 5/250 2026-03-19 18:22 by zcl123
[考研] 0703化学调剂 +4 18889395102 2026-03-18 4/200 2026-03-19 16:13 by 30660438
信息提示
请填处理意见