24小时热门版块排行榜    

查看: 2372  |  回复: 33
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

kingjazz23

金虫 (小有名气)

[求助] CRISPR/Cas系列问题 已有1人参与

您们好,今年研一下学期老板打算做CRISPR/Cas,叫我查查问题,我们打算做酵母的CRISPR/Cas,看了几篇文献,有些问题不是很懂,所以想问问你们:
(1)在paper中经常会看到一个a premature stop codon,想问问他有什么作用,一般看到都是用研究人员在PAM的位置引入的,不太清楚他们的意图是什么?
(2)经常在paper中看到gRNA cassette和plasmid,我知道plasmid是质粒的意思,而前面那个cassette不太清楚是什么意思,在DiCarlo的一篇文献中,他提到了两种gRNA的表达方法,一个是gRNA PCR cassette还有一个是gRNA plasmid,这两个到底有什么区别?
(3)经常在文章中出现的target sequence是存在于gRNA上的那段识别目标DNA的序列还是指含有PAM序列那段序列?
(4)文章中有时候会出现的tRNA是指tracrRNA吗?
(5)同样是在DiCarlo那篇文献中,其中有一句话是Donor DNA was designed to recombine within the gRNA CAN1.Y genomic target using homology arms to the site,
想问问这句话是什么意思?Donor DNA不是应该与基因组序列配对吗?通过同源臂进行修复,达到替换的效果,这里为什么说是与gRNA结合呢?
(6)文献中常常出现的oligonucleotide是指Donor DNA吗?

以上这些就是本人一些不太理解的地方,希望各路大神帮忙解决一下,谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kingjazz23

金虫 (小有名气)

忘记把这篇文章贴出来了,这篇文章是DiCarlo在2013年发表的《Genome engineering in Saccharomyces cerevisiae using CRISPR-Cas systems》
15楼2016-03-11 22:27:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 34 个回答

王继楼马

新虫 (小有名气)

已关注这个问题,目前课题涉及CRISPR-CAS9,原理还是懂,先推荐楼主看中文的说明再去看英文的文献,会好很多。因为很多概念你只有中文才能理解透彻。抱歉先关注,这两天闲下来的时候再共同讨论。
2楼2016-03-11 20:52:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ken19860823

木虫 (正式写手)

1.蛋白质翻译起始于atg,终止于三个终止子。如果前面的序列提前突变成终止子就是premature stop codon了。。2.一个表达单元叫cassette,包含启动子cds

发自小木虫Android客户端
做基因修饰的老菜鸡
3楼2016-03-11 21:06:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happykings

木虫 (正式写手)

4楼2016-03-11 21:09:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 289求调剂 +7 硕星赴 2026-03-23 7/350 2026-03-24 19:10 by 了了了了。。
[考研] 0854电子信息求调剂 +5 α____ 2026-03-22 6/300 2026-03-24 17:42 by wmk
[考研] 材料学硕,求调剂 6+3 糖葫芦888ll 2026-03-22 7/350 2026-03-24 17:11 by hello七七
[考研] 一志愿哈工大,085400,320,求调剂 +3 gdlf9999 2026-03-24 3/150 2026-03-24 10:08 by 搏击518
[考研] 一志愿山东大学药学学硕求调剂 +3 开开心心没烦恼 2026-03-23 4/200 2026-03-24 00:06 by 开开心心没烦恼
[考研] 291求调剂 +8 hhhhxn.. 2026-03-23 8/400 2026-03-23 23:15 by peike
[考研] 材料专业求调剂 +11 hanamiko 2026-03-18 11/550 2026-03-23 23:12 by peike
[考研] 316求调剂 +7 梁茜雯 2026-03-19 7/350 2026-03-23 16:21 by lingjue
[考研] 328求调剂 +4 LHHL66 2026-03-23 4/200 2026-03-23 14:55 by lbsjt
[考研] 323求调剂 +6 洼小桶 2026-03-18 6/300 2026-03-23 00:29 by king123!
[考研] 石河子大学(211、双一流)硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
[考研] 285求调剂 +6 ytter 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:09 by 星空星月
[考研] 286求调剂 +10 Faune 2026-03-21 10/500 2026-03-21 23:34 by 314126402
[考研] 材料学硕333求调剂 +3 北道巷 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:17 by 学员8dgXkO
[考研] 求助 +5 梦里的无言 2026-03-21 6/300 2026-03-21 17:51 by 学员8dgXkO
[考研] 302求调剂 +12 呼呼呼。。。。 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:29 by ColorlessPI
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境专硕,总分308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:39 by JourneyLucky
[考研] 考研调剂求学校推荐 +3 伯乐29 2026-03-18 5/250 2026-03-20 22:59 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +4 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:15 by JourneyLucky
[考研] 材料学求调剂 +4 Stella_Yao 2026-03-20 4/200 2026-03-20 20:28 by ms629
信息提示
请填处理意见