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穆子涵

金虫 (初入文坛)

[求助] 关于体外转录的一些细节问题,还请做过这方面实验的大神不吝赐教 已有1人参与

最近因实验需要,要体外转录获得一段RNA进行相关反应,无奈,之前并未接触过体外反应的相关操作,已进行了数次实验,结果均不理想。特来版上求助有做过相关方面实验的大神们,希望诸位能不吝赐教,万分感激

需要转录的RNA长度较短,全长也才180bp左右,使用的启动子为各类载体上常用的T7启动子(TAATACGACTCACTATAGG),通过高保真PCR,后面直接接上了我的片段,以产物片段作为体外反应的模板,使用的是NEB的T7 RNA聚合酶,模板用量为50uL体系加入了200ng PCR产物片段,100U的RNA聚合酶,NTP浓度为各0.5mM。反应时间为37℃ 2h。后用取产物2.5uL 用1%的琼脂糖凝胶电泳检测,仅发现有一条条带,经过对照分析,该条带为模板DNA片段。

有如下几个问题,还请大神们能够予以指点:

1. 启动子长度是不是偏短,导致聚合酶无法正常附着于模板DNA上?

2. 反应体系中的模板用量是否偏低?因为参考说明书上的检测实验,50uL反应体系的模板用量一般在1ug左右。

3. 聚合酶的用量是否合适?

4. 反应时间是否充足?参看版上的一个帖子说,片段短于200b时,反应时间需要延长,那么延长多少比较合适?

5. 如果反应完成后想进行聚合酶的失活,是不是高温条件下放置数分钟即可?

麻烦诸位大神指点一二,在此先行谢过。
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百善孝为先。
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小胖子lxm

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

遇到同样的问题,好无奈啊
3楼2019-12-16 19:46:12
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查看全部 3 个回答

sssnnnfff

新虫 (初入文坛)

你好!我最近做体外转录的效率很低,条带时有时无。能向你请教一下你体外转录用试剂盒了吗?产率如何?
2楼2017-05-22 13:08:23
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