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1楼 2016-03-09 14:16:56

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29楼: Originally posted by 1245708951 at 2016-03-14 10:14:11
你是说选择的中心节点吗？恩，我画出来的中心节点是Ag1、Ag2和Mo8核簇，并且应该是这样的连接six-connected node (Ag1), six-connected node (Ag2) and eight-connected node (Mo8) ，可是用拓扑分析出来的好像不太 ...

我已经给你解释了银二的银氧建太长了，所以我的是那样的，如果你考虑个键情况肯定不一样

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32楼2016-03-14 10:30:23

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忘记考虑Ag之间的连接了
###########
1:1 in P2/c
###########

Topology for Mo1
--------------------
Atom Mo1 links by bridge ligands and has
Common vertex with                               R(A-A)
Ag 1 0.0000 0.6660 -0.2500 ( 0 0-1)    5.612A       1
Ag 1 1.0000 0.3340 0.2500 ( 1 1 1)    5.612A       1
Ag 2 1.0000 0.0000 0.0000 ( 1 0 0)    7.445A       1
Ag 2 0.0000 1.0000 0.0000 ( 0 1 0)    7.445A       1
Ag 1 0.0000 -0.3340 -0.2500 ( 0-1-1) 10.184A       1
Ag 1 1.0000 1.3340 0.2500 ( 1 2 1) 10.184A       1
Ag 2 1.0000 0.0000 0.5000 ( 1 0 0) 10.601A       1
Ag 2 0.0000 1.0000 -0.5000 ( 0 1-1) 10.601A       1
Topology for Ag1
--------------------
Atom Ag1 links by bridge ligands and has
Common vertex with                               R(A-A)
Mo 1 0.5000 0.5000 1.0000 ( 0 0 1)    5.612A       1
Mo 1 -0.5000 0.5000 0.5000 ( 0 0 0)    5.612A       1
Ag 2 0.0000 1.0000 1.0000 ( 0 1 1)    6.358A       1
Ag 2 0.0000 1.0000 0.5000 ( 0 1 0)    6.358A       1
Mo 1 0.5000 1.5000 1.0000 ( 0 1 1) 10.184A       1
Mo 1 -0.5000 1.5000 0.5000 ( 0 1 0) 10.184A       1
Topology for Ag2
--------------------
Atom Ag2 links by bridge ligands and has
Common vertex with                               R(A-A)
Ag 1 0.0000 -0.3340 -0.2500 ( 0-1-1)    6.358A       1
Ag 1 0.0000 0.3340 0.2500 ( 0 1 1)    6.358A       1
Mo 1 0.5000 -0.5000 0.0000 ( 0-1 0)    7.445A       1
Mo 1 -0.5000 0.5000 0.0000 (-1 0 0)    7.445A       1
Mo 1 0.5000 0.5000 0.5000 ( 1 0 0) 10.601A       1
Mo 1 -0.5000 -0.5000 -0.5000 ( 0-1-1) 10.601A       1
-------------------------
Structural group analysis
-------------------------

-------------------------
Structural group No 1
-------------------------
Structure consists of 3D framework with Ag2Mo

Coordination sequences
----------------------
Mo1:  1  2 3 4 5 6 7 8 9 10
Num 8 24  74 106 236 248  486  446  824  700
Cum 9 33 107 213 449 697 1183 1629 2453 3153
----------------------
Ag1:  1  2  3 4 5 6 7 8 9 10
Num 6 24 58 126 182 320  360  606  594  980
Cum 7 31 89 215 397 717 1077 1683 2277 3257
----------------------
Ag2:  1  2  3 4 5 6 7 8 9 10
Num 6 24 60 134 174 338  346  630  574 1010
Cum 7 31 91 225 399 737 1083 1713 2287 3297
----------------------
TD10=3236

Vertex symbols for selected sublattice
--------------------------------------
Mo1 Point symbol:{3^4.4^10.5^4.6^8.7^2}
Extended point symbol:[3.3.3.3.4.4.4.4.4.4.4.4.4(2).4(2).5.5.5.5.6.6.6.6.6.6.6(2).6(4).7(2).7(2)]
--------------------------------------
Ag1 Point symbol:{3^4.4^5.5^4.6^2}
Extended point symbol:[3.3.3.3.4.4.4(2).4(3).4(3).5.5.5.5.6(6).6(6)]
--------------------------------------
Ag2 Point symbol:{3^4.4^2.6^7.7^2}
Extended point symbol:[3.3.3.3.4(3).4(3).6.6.6(2).6(4).6(4).6(4).6(4).7(10).7(10)]
--------------------------------------
Point symbol for net: {3^4.4^10.5^4.6^8.7^2}{3^4.4^2.6^7.7^2}{3^4.4^5.5^4.6^2}
6,6,8-c net with stoichiometry (6-c)(6-c)(8-c); 3-nodal net

New topology, please, contact the authors (16813 types in 3 databases)
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2楼: Originally posted by lich666 at 2016-03-09 15:12:17
Topos软件可以分析拓扑符号。

好像是可以把diamond拓扑图生成cif文件然后直接导入topos吗？导入之后该怎么操作，刚才摸索了一下topos软件，没弄明白，谢谢！

3楼2016-03-09 15:21:45

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加油，baby！！！

4楼2016-03-09 15:41:08

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下载topos 4.0, 用XP简化res，导入tiopos 计算就行了

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5楼2016-03-09 17:07:17

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引用回帖:

5楼: Originally posted by wangningsir at 2016-03-09 17:07:17
下载topos 4.0, 用XP简化res，导入tiopos 计算就行了

XP简化res是什么意思？不太懂，能不能说一下怎么操作，谢谢了

6楼2016-03-09 17:10:30

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8楼: Originally posted by wangningsir at 2016-03-09 17:19:18
给你贴个具体例子：
Simplify res: (in xp)
Envi er1 8       (see sym no of er1a)
Sgen 2666       (get er1a)
Cent/x er1 er1a    (insert dummy atom x1a)
Name x1a er2       (rename dummy atom ...

用XP简化res那一部分内容是要自己根据晶体结构输入的吗？我没有用过XP，不知道怎么用呢？

9楼2016-03-09 17:32:06

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引用回帖:

我这有diamond拓扑结构的cif文件，topos软件也不太会用，能不能用这个cif文件在topos里直接进行操作的方法，谢谢