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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 用diamond画出来的拓扑图怎么分析它的拓扑符号
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1245708951

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
27楼: Originally posted by 0809293 at 2016-03-11 09:36:17
感谢有你！！！有问题再向你请教！...

不客气
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31楼2016-03-14 10:23:02
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文言文

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
29楼: Originally posted by 1245708951 at 2016-03-14 10:14:11
你是说选择的中心节点吗？恩，我画出来的中心节点是Ag1、Ag2和Mo8核簇，并且应该是这样的连接six-connected node (Ag1), six-connected node (Ag2) and eight-connected node (Mo8) ，可是用拓扑分析出来的好像不太 ...

我已经给你解释了银二的银氧建太长了，所以我的是那样的，如果你考虑个键情况肯定不一样

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32楼2016-03-14 10:30:23
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wangningsir

木虫 (著名写手)

上书房行走
忘记考虑Ag之间的连接了
###########
1:1 in P2/c
###########

Topology for Mo1
--------------------
Atom Mo1 links by bridge ligands and has
Common vertex with                                R(A-A)
Ag 1    0.0000    0.6660   -0.2500   ( 0 0-1)     5.612A        1
Ag 1    1.0000    0.3340    0.2500   ( 1 1 1)     5.612A        1
Ag 2    1.0000    0.0000    0.0000   ( 1 0 0)     7.445A        1
Ag 2    0.0000    1.0000    0.0000   ( 0 1 0)     7.445A        1
Ag 1    0.0000   -0.3340   -0.2500   ( 0-1-1)    10.184A        1
Ag 1    1.0000    1.3340    0.2500   ( 1 2 1)    10.184A        1
Ag 2    1.0000    0.0000    0.5000   ( 1 0 0)    10.601A        1
Ag 2    0.0000    1.0000   -0.5000   ( 0 1-1)    10.601A        1
Topology for Ag1
--------------------
Atom Ag1 links by bridge ligands and has
Common vertex with                                R(A-A)
Mo 1    0.5000    0.5000    1.0000   ( 0 0 1)     5.612A        1
Mo 1   -0.5000    0.5000    0.5000   ( 0 0 0)     5.612A        1
Ag 2    0.0000    1.0000    1.0000   ( 0 1 1)     6.358A        1
Ag 2    0.0000    1.0000    0.5000   ( 0 1 0)     6.358A        1
Mo 1    0.5000    1.5000    1.0000   ( 0 1 1)    10.184A        1
Mo 1   -0.5000    1.5000    0.5000   ( 0 1 0)    10.184A        1
Topology for Ag2
--------------------
Atom Ag2 links by bridge ligands and has
Common vertex with                                R(A-A)
Ag 1    0.0000   -0.3340   -0.2500   ( 0-1-1)     6.358A        1
Ag 1    0.0000    0.3340    0.2500   ( 0 1 1)     6.358A        1
Mo 1    0.5000   -0.5000    0.0000   ( 0-1 0)     7.445A        1
Mo 1   -0.5000    0.5000    0.0000   (-1 0 0)     7.445A        1
Mo 1    0.5000    0.5000    0.5000   ( 1 0 0)    10.601A        1
Mo 1   -0.5000   -0.5000   -0.5000   ( 0-1-1)    10.601A        1
-------------------------
Structural group analysis
-------------------------

-------------------------
Structural group No 1
-------------------------
Structure consists of 3D framework with Ag2Mo

Coordination sequences
----------------------
Mo1:  1  2   3   4   5   6    7    8    9   10
Num   8 24  74 106 236 248  486  446  824  700
Cum   9 33 107 213 449 697 1183 1629 2453 3153
----------------------
Ag1:  1  2  3   4   5   6    7    8    9   10
Num   6 24 58 126 182 320  360  606  594  980
Cum   7 31 89 215 397 717 1077 1683 2277 3257
----------------------
Ag2:  1  2  3   4   5   6    7    8    9   10
Num   6 24 60 134 174 338  346  630  574 1010
Cum   7 31 91 225 399 737 1083 1713 2287 3297
----------------------
TD10=3236

Vertex symbols for selected sublattice
--------------------------------------
Mo1 Point symbol:{3^4.4^10.5^4.6^8.7^2}
Extended point symbol:[3.3.3.3.4.4.4.4.4.4.4.4.4(2).4(2).5.5.5.5.6.6.6.6.6.6.6(2).6(4).7(2).7(2)]
--------------------------------------
Ag1 Point symbol:{3^4.4^5.5^4.6^2}
Extended point symbol:[3.3.3.3.4.4.4(2).4(3).4(3).5.5.5.5.6(6).6(6)]
--------------------------------------
Ag2 Point symbol:{3^4.4^2.6^7.7^2}
Extended point symbol:[3.3.3.3.4(3).4(3).6.6.6(2).6(4).6(4).6(4).6(4).7(10).7(10)]
--------------------------------------
Point symbol for net: {3^4.4^10.5^4.6^8.7^2}{3^4.4^2.6^7.7^2}{3^4.4^5.5^4.6^2}
6,6,8-c net with stoichiometry (6-c)(6-c)(8-c); 3-nodal net

New topology, please, contact the authors (16813 types in 3 databases)
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33楼2016-03-14 12:25:41
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1245708951

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
32楼: Originally posted by 文言文 at 2016-03-14 10:30:23
我已经给你解释了银二的银氧建太长了，所以我的是那样的，如果你考虑个键情况肯定不一样
...

恩，这样啊，谢谢
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34楼2016-03-14 13:53:47
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1245708951

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
33楼: Originally posted by wangningsir at 2016-03-14 12:25:41
忘记考虑Ag之间的连接了
###########
1:1 in P2/c
###########

Topology for Mo1
--------------------
Atom Mo1 links by bridge ligands and has
Common vertex with                                R( ...

十分感谢
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35楼2016-03-14 13:56:08
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1245708951

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
33楼: Originally posted by wangningsir at 2016-03-14 12:25:41
忘记考虑Ag之间的连接了
###########
1:1 in P2/c
###########

Topology for Mo1
--------------------
Atom Mo1 links by bridge ligands and has
Common vertex with                                R( ...

不好意思啊，还得麻烦你，我想问一下你帮忙用topos分析出来的图片有没有清晰一点的，有没有其他角度的图片，谢谢啊，实在不好意思，再次叨扰
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36楼2016-03-14 19:13:55
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wangningsir

木虫 (著名写手)

上书房行走
见附件
用diamond画出来的拓扑图怎么分析它的拓扑符号
top.jpg
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文艺青年researchid: http://www.researcherid.com/rid/G-7891-2011
37楼2016-03-14 22:02:11
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wangningsir

木虫 (著名写手)

上书房行走
直接用附件，在topos里画图也行
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    • 2016-03-14 22:04:59, 7.92 K

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1245708951
文艺青年researchid: http://www.researcherid.com/rid/G-7891-2011
38楼2016-03-14 22:05:36
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1245708951

金虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
38楼: Originally posted by wangningsir at 2016-03-14 22:05:36
直接用附件，在topos里画图也行

谢谢发的图和附件，我已经收到了，我还在慢慢摸索，能不能问一下，从topos里边能导出像素好点的图片吗？谢谢，
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39楼2016-03-20 10:33:03
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wangningsir

木虫 (著名写手)

上书房行走
引用回帖:
39楼: Originally posted by 1245708951 at 2016-03-20 10:33:03
谢谢发的图和附件，我已经收到了，我还在慢慢摸索，能不能问一下，从topos里边能导出像素好点的图片吗？谢谢，...

没那么高像素，可以用发你的res文件在diamond中做高像素的图。
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文艺青年researchid: http://www.researcherid.com/rid/G-7891-2011
40楼2016-03-21 09:59:18
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