应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » NAMD如何自定义力
31/1返回列表
查看: 427  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

franktang

新虫 (小有名气)

[求助] NAMD如何自定义力 已有1人参与

在NAMD-userguide里的第九部分看到了自定义力的介绍，涉及到几个参数的设定，但是并没有说明是在哪里加入这几个参数，是在配置文件中修改吗？多谢了！

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2016-03-06 10:49:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

supertype

捐助贵宾 (初入文坛)

【答案】应助回帖

立场文件中主要包括 BONDS ANGLES DIHEDRALS 。。。
等几个参数，你自己的立场参数可以分别放到这几个部分中去。
但一般的做法是自己的力场参数单独存放。在conf文件中加上就可以
SIMULATION PARAMETERS 部分加上
parameters ../selfdir/self.par
赞一下 回复此楼
2楼2016-03-21 15:54:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

franktang

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by supertype at 2016-03-21 15:54:11
立场文件中主要包括 BONDS ANGLES DIHEDRALS 。。。
等几个参数，你自己的立场参数可以分别放到这几个部分中去。
但一般的做法是自己的力场参数单独存放。在conf文件中加上就可以
SIMULATION PARAMETERS 部分加上 ...

你好，还想问一下在运行仿真的时候，显示错误无法打开CHARMM参数文件prm是什么原因呢？多谢

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2016-03-21 21:40:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 franktang 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭