24小时热门版块排行榜    

查看: 2330  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

flyer0505

银虫 (小有名气)

[交流] 有没有人做过聚合物和蛋白质的分子对接 已有5人参与


我现在正在做聚合物与受体蛋白的相互作用研究。真是一个负复杂的过程,聚合物太大整体是不能进入结合位点的,只能考虑聚合物的某个片段结合到蛋白的活性位点部位,这是我研究的思路:因为聚合物链太长,考虑到蛋白质活性位点的空间几何结构,本人将聚合物切断为几个不同的片段(每个片段是不同的小分子),分别将它们对接到受体蛋白的结合位点,然后比较每个片段的得分(亲和力大小),得分大的则认为这个片段会优先结合到受体蛋白的口袋里面,聚合物的其他片段则没有进入到口袋里面。不知道这样设计可不可行,请大家帮帮忙。
另外,是否有研究聚合物与受体蛋白相互作用的对接软件?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

earth

木虫 (小有名气)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你的想法可以通过实验验证。比如分别合成片段分子,通过SPR,ITC等生物物理方法去验证哪个片段与蛋白互作,回过头来做模拟更合适。
5楼2016-03-06 12:37:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

螺旋藻

木虫 (正式写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
同问,没有看到类似文献。
3楼2016-03-03 23:24:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

螺旋藻

木虫 (正式写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gromacs 听说能用,可以试试。我也是问论坛大神的,完全不懂
4楼2016-03-03 23:58:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)


HEX、ZDOCK等均可以做蛋白-蛋白对接
6楼2016-03-07 09:44:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 厉娜 +4 张丹枫1991 2026-11-09 6/300 2026-11-15 00:48 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 YHiw1gou1Eda 2026-11-10 7/350 2026-11-14 22:44 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 YHiw1gou1Eda 2026-11-10 8/400 2026-11-14 22:20 by Equinoxhua
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-14 22:04 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 7/350 2026-11-14 21:58 by Equinoxhua
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 TZqyNTBa07NP 2026-11-13 3/150 2026-11-14 15:58 by KXypaGgBBlw7
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 1Nb0IVlmV6v0 2026-11-11 4/200 2026-11-13 11:18 by Equinoxhua
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 gRND4NVAZ8VG 2026-11-11 5/250 2026-11-13 11:15 by Equinoxhua
[考博] 27博士申请(市政/环境) +3 ladf 2026-11-12 3/150 2026-11-13 08:19 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 cdqGD6ftHmbl 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:26 by ECLTXnJnRSXf
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 czAiolzR0IJC 2026-11-10 8/400 2026-11-12 11:11 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:00 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 8/400 2026-11-12 10:49 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 11/550 2026-11-12 09:57 by HajghKOMynmz
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-12 09:46 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +7 FChKX8meu1ds 2026-11-09 12/600 2026-11-12 09:43 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 12/600 2026-11-12 09:32 by HajghKOMynmz
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 cdqGD6ftHmbl 2026-11-11 3/150 2026-11-12 07:53 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 7/350 2026-11-12 05:19 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 8/400 2026-11-12 05:00 by 9fOTqj074tIg
信息提示
请填处理意见