24小时热门版块排行榜    

查看: 1902  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

好孩子坏孩子

金虫 (著名写手)

[交流] Autodock对接能量小于多少认为对接成功 已有4人参与

利用Autodock做分子对接是,对接能量小于多少认为对接成功呢?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

flyingcity

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
要先用晶体结构中的配体进行对接(redock),直到获得跟晶体结构中很相似的构象,以这个为标准来衡量你新设计的化合物的结合能,对接结合能是相对值,不是绝对值,所以要先建立参照系。在进行redock的时候,尽量多用几个带配体的晶体结构,看哪个的配体和你的配体结构类似,就选哪个。
4楼2016-02-29 10:53:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

张德涛

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
感觉没有一个确定的数,不是有设置对接构像的个数么?我都是选择对接构象中能量低的那一个

发自小木虫Android客户端
2楼2016-02-29 00:00:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿狸1205

捐助贵宾 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
最好是有一个阳性对照,就能大概确定对接效果了
3楼2016-02-29 09:34:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pymol

捐助贵宾 (正式写手)


对接能量只要为负值就可以,能量越低越稳定
5楼2016-03-03 09:29:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +22 医学老男孩 2026-08-13 48/2400 2026-08-14 18:33 by wuguocheng
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +10 Tide man 2026-08-10 11/550 2026-08-14 10:30 by 沁言学术
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[硕博家园] 一作与独作在应聘高校教师时区别大吗 +3 mbygzh 2026-08-08 4/200 2026-08-13 19:31 by 龙-樱
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
信息提示
请填处理意见