24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1798  |  回复: 4

好孩子坏孩子

金虫 (著名写手)

[交流] Autodock对接能量小于多少认为对接成功 已有4人参与

利用Autodock做分子对接是,对接能量小于多少认为对接成功呢?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张德涛

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
感觉没有一个确定的数,不是有设置对接构像的个数么?我都是选择对接构象中能量低的那一个

发自小木虫Android客户端
2楼2016-02-29 00:00:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿狸1205

捐助贵宾 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
最好是有一个阳性对照,就能大概确定对接效果了
3楼2016-02-29 09:34:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

flyingcity

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
要先用晶体结构中的配体进行对接(redock),直到获得跟晶体结构中很相似的构象,以这个为标准来衡量你新设计的化合物的结合能,对接结合能是相对值,不是绝对值,所以要先建立参照系。在进行redock的时候,尽量多用几个带配体的晶体结构,看哪个的配体和你的配体结构类似,就选哪个。
4楼2016-02-29 10:53:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pymol

捐助贵宾 (正式写手)


对接能量只要为负值就可以,能量越低越稳定
5楼2016-03-03 09:29:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 好孩子坏孩子 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工调剂一志愿大连海事085600,349 +4 吃的不少 2026-03-30 4/200 2026-03-30 23:18 by wxiongid
[考研] 理学07化学 303求调剂 +3 睿08 2026-03-27 3/150 2026-03-30 23:13 by 迷糊CCPs
[考研] 一志愿华东师范大学有机化学专业,初试351分,复试被刷求调剂! +7 真名有冰 2026-03-29 8/400 2026-03-30 21:08 by maaj02
[考研] 303求调剂 +7 DLkz1314. 2026-03-30 7/350 2026-03-30 21:07 by peike
[考研] 322求调剂 +10 宋明欣 2026-03-27 10/500 2026-03-30 18:47 by 544594351
[考研] 材料化工340求调剂 +3 jhx777 2026-03-30 3/150 2026-03-30 17:54 by JourneyLucky
[考研] 085602 化学工程专硕 340分求调剂 +4 qianbai11 2026-03-29 4/200 2026-03-30 11:34 by 唐沐儿
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +4 邱gl 2026-03-26 7/350 2026-03-30 08:39 by 探123
[考研] 总分293求调剂 +8 加一一九 2026-03-25 11/550 2026-03-29 19:53 by 无际的草原
[考研] 食品工程专硕一志愿中海洋309求调剂 +4 小张zxy张 2026-03-26 8/400 2026-03-28 19:25 by lbsjt
[考研] 一志愿华理,数一英一285求A区调剂 +8 AZMK 2026-03-25 12/600 2026-03-28 18:15 by AZMK
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-03-27 6/300 2026-03-28 14:10 by 唐沐儿
[考研] 266分,求材料冶金能源化工等调剂 +7 哇呼哼呼哼 2026-03-27 9/450 2026-03-28 12:22 by zllcz
[考研] 0856,材料与化工321分求调剂 +12 大馋小子 2026-03-27 13/650 2026-03-28 10:56 by self2008
[考研] 086502化学工程342求调剂 +6 阿姨复古不过 2026-03-27 6/300 2026-03-28 07:06 by wangy0907
[考研] 340求调剂 +5 jhx777 2026-03-27 5/250 2026-03-28 04:18 by fmesaito
[考研] 295求调剂 +5 1428151015 2026-03-27 6/300 2026-03-28 04:04 by fmesaito
[考研] 考研调剂 +10 呼呼?~+123456 2026-03-24 10/500 2026-03-27 11:46 by wangjy2002
[考研] 一志愿天津大学339材料与化工求调剂 +3 江往卖鱼 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:42 by 王小欠i
[考研] 300分,材料,求调剂,英一数二 +5 超赞的 2026-03-24 5/250 2026-03-24 21:07 by 星空星月
信息提示
请填处理意见