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prthefu

木虫 (著名写手)

[交流] 电泳条带拖尾和出现杂带 已有3人参与

PCR后进行跑胶检测,发现跑完胶之后,在紫外照射之前,拿到的胶为下面的那种情况,肉眼看到的后面两个图中,其中浅蓝色的为目的条带,但是两位的那些深蓝色的是什么啊,是非特异条带吗?
还有,在紫外照射图片中,目的条带跑成那样,能进行胶回收吗?

电泳条带拖尾和出现杂带
P60226-091039-001.jpg.JPG


电泳条带拖尾和出现杂带-1
P60226-091313.jpg.JPG


电泳条带拖尾和出现杂带-2
P60226-091345.jpg.JPG
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fjtony163

版主 (文坛精英)

米米

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
那个蓝色只是loading dye吧,大部分电泳时都要往样品里加的
2楼2016-02-26 09:46:11
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xiangyingliu

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
可以的胶回收了,前面的蓝色的条带是溴酚蓝,代表的片段大小是 300bp,后面的有点绿色的条带是二甲苯青,代表的片段大小在4000bp左右。 loading buffer的功能主要有两个。第一,里边的指示剂溴酚蓝和二甲苯酚起到指示的作用,显示电泳的进程,以便我们适时终止电泳;第二,里边的成分甘油可以加大样品密度,使样品密度大于TAE,从而沉降到点样孔中,防止样品飘出点样孔。另外,有的Buffer是加有SDS的,一般都会写明。SDS主要是促使聚合酶变性,因为没有除尽的聚合酶会结合在DNA双链上影响它的迁移速率。细胞裂解后的裂解液,加loading 100℃加热,也是为了中止酶促反应,防止提取的蛋白质降解

发自小木虫Android客户端
3楼2016-02-26 09:48:19
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xiangyingliu

银虫 (小有名气)

肉眼是看不见条带的,那两条蓝色的是指示大概位置的

发自小木虫Android客户端
4楼2016-02-26 09:49:13
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oliviashane

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
浅蓝色的条带不是你的目的基因的条带。
那是核酸电泳常用的指示剂,溴酚蓝(Bromophenol Blue, Bb),呈蓝紫色;二甲苯青(Xylene Cyannol,Xc),呈蓝色。
溴酚蓝的分子量为670道尔顿,在琼脂糖凝胶中移动的速率约为二甲苯青FF的2.2倍, 溴酚蓝在琼脂糖凝胶中移动的速率约与长300bp的双链线性DNA相同,而二甲苯青在琼脂糖凝胶中移动的速率则与4kb双链线性DNA相同.
二甲苯青的分子量为554.6道尔顿,携带的电荷量比溴酚蓝少,在凝胶中泳动率比溴酚蓝慢。
与指示剂迁移相当的DNA大小与凝胶浓度的关系
琼脂糖凝胶(%) 二甲苯青(bp) 溴酚蓝(bp)
2.0                  4000              300
1.5                  2000              250
5楼2016-02-26 10:30:21
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prthefu

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xiangyingliu at 2016-02-26 09:48:19
可以的胶回收了,前面的蓝色的条带是溴酚蓝,代表的片段大小是 300bp,后面的有点绿色的条带是二甲苯青,代表的片段大小在4000bp左右。 loading buffer的功能主要有两个。第一,里边的指示剂溴酚蓝和二甲苯酚起到指 ...

谢谢
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6楼2016-03-01 08:21:33
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prthefu

木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by oliviashane at 2016-02-26 10:30:21
浅蓝色的条带不是你的目的基因的条带。
那是核酸电泳常用的指示剂,溴酚蓝(Bromophenol Blue, Bb),呈蓝紫色;二甲苯青(Xylene Cyannol,Xc),呈蓝色。
溴酚蓝的分子量为670道尔顿,在琼脂糖凝胶中移动的速率约为二 ...

感谢
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7楼2016-03-01 08:22:19
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