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1008106004新虫 (小有名气)
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[求助]
求助用pymol画多肽三维结构 已有2人参与
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| 各位有没有知道怎么根据多肽的序列，用pymol软件构建出这个多肽的三维结构模型，（用pymol软件来构建模型的时候是不是都要首先找到其相应的PDB文件才可以？我手头的这个多肽只知道它的氨基酸序列，不知道名字，这种情况该怎么用pymol来构建出三维模型呢？）急用，多谢了！ |
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3楼2016-04-23 14:49:05
4楼2016-04-23 14:58:58
【答案】应助回帖
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1008106004: 金币+2, ★★★很有帮助 2016-06-06 10:33:36
1008106004: 金币+2, ★★★很有帮助 2016-06-06 10:33:36
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PyMOL着实不是一个好的分子模拟软件，它更适合用于分子图形显示。 多肽有多少个氨基酸？如果较少，用Amber的tleap或者其他软件构建好初步模型，然后进行分子动力学（MD）模拟即可；如果很多，采用Modeller等软件进行同源模建，再进行MD模拟。Amber和Modeller教程参见："http://www.yinfotech.cn/blog/tutorial/" |
5楼2016-04-24 10:52:42
1008106004
新虫 (小有名气)
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6楼2016-06-06 10:33:13