| 查看: 3745 | 回复: 5 | ||
1008106004新虫 (小有名气)
|
[求助]
求助用pymol画多肽三维结构 已有2人参与
|
| 各位有没有知道怎么根据多肽的序列，用pymol软件构建出这个多肽的三维结构模型，（用pymol软件来构建模型的时候是不是都要首先找到其相应的PDB文件才可以？我手头的这个多肽只知道它的氨基酸序列，不知道名字，这种情况该怎么用pymol来构建出三维模型呢？）急用，多谢了！ |
回复此楼» 猜你喜欢
8月时间戳变的，举个手。玩一下，释放压力
已经有4人回复
-
UV压敏胶开发
已经有6人回复
-
有没有H口的？有收到消息的吗？
已经有3人回复
-
十年后又回来了，论文投稿求助
已经有3人回复
-
纯娱乐，不喜欢勿喷
已经有10人回复
-
面上再次挂了，太难了，躺也躺不了，倦也卷不过，小学校之殇！
已经有26人回复
-
面上提前没消息，有中的吗
已经有18人回复
-
娱乐
已经有4人回复
-
系统今天又提示维护了，估计离放榜不远了
已经有16人回复
-
一个有机合成实验室都需要哪些设备？
已经有10人回复
2楼2016-02-26 09:09:03
3楼2016-04-23 14:49:05
4楼2016-04-23 14:58:58
【答案】应助回帖
★ ★
1008106004: 金币+2, ★★★很有帮助 2016-06-06 10:33:36
1008106004: 金币+2, ★★★很有帮助 2016-06-06 10:33:36
|
PyMOL着实不是一个好的分子模拟软件，它更适合用于分子图形显示。 多肽有多少个氨基酸？如果较少，用Amber的tleap或者其他软件构建好初步模型，然后进行分子动力学（MD）模拟即可；如果很多，采用Modeller等软件进行同源模建，再进行MD模拟。Amber和Modeller教程参见："http://www.yinfotech.cn/blog/tutorial/" |
5楼2016-04-24 10:52:42
1008106004
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1661.2
- 散金: 35
- 红花: 1
- 帖子: 68
- 在线: 28.6小时
- 虫号: 3040519
- 注册: 2014-03-11
- 专业: 生化分析及生物传感
6楼2016-06-06 10:33:13