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生物科学 本地化blast在下载完35个nt文件并解压缩后如何构建本地blast nt...
Noaliasorindexfilefoundfornucleotidedatabase[nt]insearchpathhome/j0126/genome_env:/home/j0126/genome_env/blast+:]j0126ubuntu:~/genome_env$makeblastdb-innt-dbtypenucl-parse_...
e746700020 2021-04-21 11:30
分子生物 NR库本地Blast的的101个包怎么处理?
从NCBI上下载了NR库,一共101个包,解压完是从nr.00到nr.100一共101套makeblastdb文件。如果本地blast时db参数直接写nr的话,提示找不到nr库,如blastn-querynr_test.fasta-dbnr-outnr_test...
seamas_gao5 2018-10-28 02:00
分子生物 makeblastdb
makeblastdb-in10610.V10pro.fa-dbtypeprot-parse_seqidsBuildinganewDB,currenttime:09/16/201420:56:02NewDBname:10610.V10pro.faNewDBtitle:10610.V10pro.faSequencetype:...
wang4681060 2014-09-16 01:29
程序语言 本地数据库无法用makeblastdb格式化
从hmpdacc下载了一个蛋白数据库fasta格式的但里面有重复序列运行makeblastdb时会报错文件比较大在全部读进内存之前就会死机手动改不了不知有没有给本地数据库去冗余的perl模块或程序包望...
ldy2140 2012-11-27 01:25
生物科学 如何使用blast建立本地数据库(我下了很多fasta文件存放在一个...
在HMP数据库里下了很多菌株的序列想找一种酶的同源基因用blast2.2.26+时首先要makeblastdb一般-in后指向的是一个文件的路径但我现在有很多fasta文件存放在一个文件夹里(因为下载的时候是...
ldy2140 2012-06-05 02:21