| 查看: 633 | 回复: 0 | ||
| 【悬赏金币】回答本帖问题,作者e746700020将赠送您 5 个金币 | ||
[求助]
本地化blast在下载完35个nt文件并解压缩后如何构建本地blast nt库?
|
||
|
rt j0126@ubuntu:~/genome_env$ blastn -query kpn_8final.fq -db nt -outfmt 11 -out "KPN8.blastn@nt.asn" -num_threads 8 Warning: [blastn] Number of threads was reduced to 1 to match the number of available CPUs BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database [nt] in search path [/home/j0126/genome_env::/home/j0126/genome_env/blast+:] j0126@ubuntu:~/genome_env$ makeblastdb -in nt -dbtype nucl -parse_seqids Building a new DB, current time: 04/21/2021 02:18:08 New DB name: /home/j0126/genome_env/nt New DB title: nt Sequence type: Nucleotide Keep MBits: T Maximum file size: 1000000000B BLAST options error: File nt does not exist 我把nt00~35分别下载完成后全部解压缩成36个文件夹的形式,不管是blastn也好还是makeblastdb也好都不好使,网上的教程也都试了一遍并不好使。求老师解答 |
» 猜你喜欢
天津大学招2026.09的博士生,欢迎大家推荐交流(博导是本人)
已经有11人回复
表哥与省会女结婚,父母去帮带孩子被省会女气回家生重病了
已经有9人回复
AI 太可怕了,写基金时,提出想法,直接生成的文字比自己想得深远,还有科学性
已经有10人回复
同年申请2项不同项目,第1个项目里不写第2个项目的信息,可以吗
已经有10人回复
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有11人回复
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有11人回复













回复此楼