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e746700020

铁虫 (初入文坛)

[求助] 本地化blast在下载完35个nt文件并解压缩后如何构建本地blast nt库?

rt


j0126@ubuntu:~/genome_env$ blastn -query kpn_8final.fq -db nt -outfmt 11 -out "KPN8.blastn@nt.asn" -num_threads 8
Warning: [blastn] Number of threads was reduced to 1 to match the number of available CPUs
BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database [nt] in search path [/home/j0126/genome_env::/home/j0126/genome_env/blast+:]

j0126@ubuntu:~/genome_env$ makeblastdb -in nt -dbtype nucl -parse_seqids


Building a new DB, current time: 04/21/2021 02:18:08
New DB name:   /home/j0126/genome_env/nt
New DB title:  nt
Sequence type: Nucleotide
Keep MBits: T
Maximum file size: 1000000000B
BLAST options error: File nt does not exist

我把nt00~35分别下载完成后全部解压缩成36个文件夹的形式,不管是blastn也好还是makeblastdb也好都不好使,网上的教程也都试了一遍并不好使。求老师解答
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