| 查看: 628 | 回复: 0 | |||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者e746700020将赠送您 5 个金币 | |||
[求助]
本地化blast在下载完35个nt文件并解压缩后如何构建本地blast nt库？
|
|||
|
rt j0126@ubuntu:~/genome_env$ blastn -query kpn_8final.fq -db nt -outfmt 11 -out "KPN8.blastn@nt.asn" -num_threads 8 Warning: [blastn] Number of threads was reduced to 1 to match the number of available CPUs BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database [nt] in search path [/home/j0126/genome_env::/home/j0126/genome_env/blast+:] j0126@ubuntu:~/genome_env$ makeblastdb -in nt -dbtype nucl -parse_seqids Building a new DB, current time: 04/21/2021 02:18:08 New DB name: /home/j0126/genome_env/nt New DB title: nt Sequence type: Nucleotide Keep MBits: T Maximum file size: 1000000000B BLAST options error: File nt does not exist 我把nt00~35分别下载完成后全部解压缩成36个文件夹的形式，不管是blastn也好还是makeblastdb也好都不好使，网上的教程也都试了一遍并不好使。求老师解答 |
回复此楼» 猜你喜欢
自荐读博
已经有9人回复
-
投稿Elsevier的杂志（返修），总是在选择OA和subscription界面被踢皮球
已经有8人回复
-
自然科学基金委宣布启动申请书“瘦身提质”行动
已经有4人回复
-
求个博导看看
已经有18人回复