比如预测蛋白质结构的软件，都是直接输入蛋白质的序列，比如使用FASTA格式。那如果里边刚好有个事右旋的氨基酸（D-form）那该如何输入呢？谢谢！

我想从NCBI里面下载一个种菌株的全基因组fasta序列，虽然很多菌株都公布了基因组信息，但是没有公布fasta序列（这里有什么其他途径可以下载吗）。除此之外我在别人已发表的论文里面找到了...

silva数据库最新版本为138.1，文献中常用的为138版('...github里面找到了一个博主jameslz(没有留下联系邮箱)关于生成匹配usearch的silva138数据库的帖子('...

求助各位大佬，我拿到了一个细菌的测序结果，应该是用鸟枪法测的，我不太明白为什么打开之后一个fasta文件里面有很多contig，而且片段长度是由大到小排列的。请问如果我想把他组装成一个...

GeneID为15368.siRNA(1).pngGenbankID为NC_000074.6,有两条转录本,此外还需要获取基因的序列的FASTA格式。siRNA(5).png(NC表示完整的基因组分子序列,每个转录本GenbankID共有的方块即为同源...

请问为什么我在assemble2中导入rna的fasta或者ct文件，显示不了2D结构，求求问，感谢

为什么我导入RNA的我fasta或者ct文件后，主界面显示不了2D结构呢？（从官网下载的assemble2.3.zip，然后直接解压使用的，应该不是软件问题吧…）求大神解答啊

在DS中打开fasta格式的蛋白序列，然后执行Protocol-SequenceAnalysis-BLASTSearch（DSServer），选择InputDatabase为PDB_nr95,然后运行，可最后生成了一个Error.txt文件有大佬知道这是为...

我在一篇ChIP分析流程的文章上看到了library(SRAdb)，R上面这个库可以下fasta，然而我自己用怎么样都是在报错，用函数识别下SRR之类的编号结果数据都是空，难道是sqlfile()这一步就出错了吗...

最近需要计算一千多个基因序列（fasta格式）的的同义密码子使用度(RSCU)、有效密码子使用数(ENC)，如果一个一个输入使用codonW计算，费时又费力。哪位大神知道如何批量计算？

求大神们，我现在有几个基因的unigenefafasta序列，我想通过这些fasta序列生成它的.gtf文件格式，要怎么做

RT

提交全基因组序列要用到tbl2asn，已经将fasta文件和template文件和tbl2asn放在同一文件夹里了，但是tbl2asn随便输入什么符号都直接退出，tbl2asn初始界面如图所示。求大神帮助啊.怎么利用...

怎么把数据库下载（IMGPFAM）的FASTA文件转换成HMM文件（hmm模型），我看这个好像还需要进行多重序列比对的过程，该怎么操作呢？附上网上教程网址：'...

然后下载了目标物种的蛋白序列文件，运行.\hmmsearch基因名.hmm文件名.fa基因名.out结果报告：Failedtoopensequencefile文件名.fa基因名.outforreading无法生成.out文件fa后缀换成fasta不行...

利用R从uniprot数据库下载下来的fasta序列老是有引号，要怎么去才能消去呢？

我需要在一个网站下载数据'https://www.girinst.org/repbase/update/browse.php?type=All&format=FASTA&autonomous=on&nonautonomous=on&simple=on&division=Hexapoda&letter=A'，这个数据...

请问如何在IMGT数据库中找到一个胚系基因，并下载FASTA格式的核酸序列？谢谢免疫学小白，期待大佬们的回复

求大神指教，目前我有全基因组注释的GFF文件和序列组装的fasta文件，想对这文件进行进一步的分析，即通过gff注释文件，找到序列组装中的核酸序列？菜鸟一枚。

最近使用plantcare网站预测启动子的元件，提供fasta文件和邮箱，为啥总是收不到邮件，为此我每天都重新search一遍。然后还是收不到，着急分析启动子元件埃

什么软件可以把fasta格式的文件改成phy格式

然后，对它做了全基因鉴定，也没说这个菌株有什麽问题，但是我在将组装序列（fasta）上传到NCBI时，NCBI工作人员给我的回复，感觉把细菌的名字给改啦，下面英文部分是NCBI工作人员给回复的...

有没有什么神软件能同时对齐这么多序列？多谢大神们。