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nighthanuted

金虫 (小有名气)

[求助] 右旋的氨基酸怎么在模拟软件中输入? 已有1人参与

比如预测蛋白质结构的软件,都是直接输入蛋白质的序列,比如使用FASTA格式。那如果里边刚好有个事右旋的氨基酸(D-form)那该如何输入呢?
  谢谢!!!
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fuyuandj86

版主 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
nighthanuted: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2023-09-13 15:31:07
如果你说的是AlphaFold的话,那么AlphaFold是不支持非天然氨基酸的。
基于机器学习的蛋白预测工具因为其训练数据就没有非天然氨基酸,所以是无法生成带有非天然氨基酸的结构的。
The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
2楼2023-09-12 11:29:00
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