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分类 共搜索到 17 个相关话题(最多显示前5000个) 作者 最后发表
文献求助 J Vis Exp
Liu,S.Wang,Z.Zhu,R.Wang,F.Cheng,Y.Liu,Y.ThreeDifferentialExpressionAnalysisMethodsforRNASequencing:limma,EdgeR,DESeq2JVisExp202117510.3791/62528.
dnazyme 2025-05-22 01:09
招聘信息布告栏 香港大学王宁助理教授团队诚聘研究助理(生物信息分析)
熟悉常见生物信息学分析工具,如bioconductor、deseq2、edger等4.具备数据清洗和统计分析的经验,具备机器学习算法应用者优先5.英文熟练,能在英文工作环境中沟通与写作6.较强的学习能力和...
fc28 2024-10-29 02:27
绿色求助(高悬赏) 求助Jove文献一篇
Liu,S.,Wang,Z.,Zhu,R.,Wang,F.,Cheng,Y.,Liu,Y.ThreeDifferentialExpressionAnalysisMethodsforRNASequencing:limma,EdgeR,DESeq2J.Vis.Exp.2021(175),e62528,10.3791/62528...
brightfuture01 2024-07-11 05:50
文献求助 文献求助
Liu,S.Wang,Z.Zhu,R.Wang,F.Cheng,Y.Liu,Y.ThreeDifferentialExpressionAnalysisMethodsforRNASequencing:limma,EdgeR,DESeq2JVisExp2021175doi:10.3791/62528...
micro_lsp 2023-04-28 08:20
分子生物 芯片数据分析
2.DESeq2和EdgeR包:都可用于做基因差异表达分析,主要也是用于RNA-Seq数据,同样也可以处理类似的ChIP-Seq,shRNA以及质谱数据。这两个都属于R包,其相同点在于都是对countdata数据进行处理,都...
白奥思科 2022-01-25 06:03
文献求助 wiley 一篇
[info1]DavinN1,EdgerPP2,HeferCA3,4,MizrachiE5,6,SchuetzM3,7,SmetsE1,8,MyburgAA5,6,DouglasCJ3,SchranzME9,LensF1.info'.1.'][info2]Functionalnetworkanalysisof...
killer5757 2016-04-01 04:04
分子生物 edgeR
请问这种错误该怎么解决呢:y(y)Warningmessage:InestimateCommonDisp(y):Thereisnoreplication,settingdispersiontoNA.
ldou123 2016-03-10 02:52
文献求助 edgeR for differential RNA-seq and ChIP-seq analysis:an ...
[info1]NikolayevaO,RobinsonMD.info'.1.'][info2]edgeRfordifferentialRNA-seqandChIP-seqanalysis:anapplicationtostemcellbiology.info'.2.'][info3]MethodsMolBiol...
macore 2015-05-27 03:47
文献求助 Study on the Formulas of the Dog-bone Shape of Edger Rolling...
FormulasoftheDog-boneShapeofEdgerRollinginHotStripMillinfo'.2.'][info3]AdvancedMaterialsResearchinfo'.3.'][info4]2010info'.4.'][info5]2010,97:2871-2875...
xiaohao100 2015-04-23 06:33
生物科学 edgeR做差异表达分析的前提条件和命令
edgeR做差异表达分析的前提条件有哪些?在软件中的代码是什么?
一号 2015-04-04 12:00
分子生物 转录组数据上传至GEO的问题,请会的大侠帮帮我
rawcountsforeachtranscript,and/or*normalizedabundancemeasurementsforeachtranscript,e.g.,outputfromCufflinks,Cuffdiff,DESeq,edgeR,etc.Eitherorbothofthesefilesmaybeprovided....
byqmoney 2015-03-27 05:45
分子生物 RNA-SEQ 过滤低表达基因遇到问题
结果出现如下错误:library(edgeR)Loadingrequiredpackage:limmarnaseqMatrix=read.table("t_AS_fpkm10730_Trinity_genes.not_cross_norm.fpkm.tmp",header=T,row.names=1,com='')...
hxppxh 2014-08-01 04:08
程序语言 R里edgeR和limma package分析基因表达差异的方法能否用在几组...
RT~求救各位大神~大谢~
ddhw335 2014-05-15 02:13
分子生物 Illumina高通量RNA测序数据分析中不同标准化方法的综合比较
交流:1,文中说不采用edgeR软件包进行表达差异分析,是因为它需要假设read数的分布,这个与前文是不是矛盾?2,后面提到的先把潜在表达基因去掉再计算标准化因子,是否是要先标准化,计算...
jaxb 2013-12-16 08:29
有机交流 邻二酚与胍反应
这个用什么条件比较好EDGER.jpg
20074460216 2013-01-10 06:58
公派出国 有莫有知道找差异基因包edgeR中的TMM标准化方法的 同志呀?...
SampleText[来自科研家族'哲学人生']
770349688 2012-02-29 02:28