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分类 共搜索到 34 个相关话题(最多显示前5000个) 作者 最后发表
生物科学 外泌体相关研究文献分享,轻松读完一篇文献(十)
主坐标分析(PCoA)是使用距离矩阵来获取主坐标,以可视化复杂的多维数据。LEfSe将LDA应用于被鉴定为显著不同的细菌分类群,并进一步评估每个差异丰富分类群的效应大校在这项研究中,LDA评分...
NanoFCMlxq 2021-10-23 08:26
环境 关于PCoA和Bray-Curtis
请教大神PCoA的原理是什么?为什么数据是多维的?怎样理解Bray-Curtis计算过程?
yufeiwaner 2021-09-11 03:23
硕博家园 求助16S rRNA测序beta多样性PCA,PCoA,NMDS图阴性
虫友们,求助16srRNA测序beta多样性PCA,PCoA,NMDS图干预组菌群和对照组没有区分开来该怎么办,基本重合,所以结果没有展示,但是现在修回,审稿人问beta多样性如何,该怎么回复?...
Weirdo952 2021-07-10 10:02
硕博家园 PCoA降维求助
请问谁会用R语言或者Canoco进行PCoA降维,进行数据导出呀,降维的结果看不懂怎么用了,求助大神
抹茶奶昔I 2020-12-06 06:50
论文投稿 Pcoa时,要几个重复才能做出置信椭圆啊。
求助:做Pcoa时,要几个重复才能做出置信椭圆埃
青青的青的青 2020-11-09 06:19
微生物 PCOA不知道该如何提取特征向量
我想基于系统发育特征向量回归(PVR)分析系统发育对植物某一特征的影响,利用主坐标分析(pcoa)求出了系统发育距离矩阵的特征向量,目前遇到的困难是不知道从中提取哪几个特征向量进行...
zhongyuzhuyu 2020-07-17 04:50
微生物 单分子测序揭示饮用水滤池介质微生物群落差异
PCoA结果表明,磁铁砂和锰砂的生物膜微生物群落存在差异,随时间推移,两种反应体系中微生物群落差异逐渐减校分层聚类分析结果表明,在第80d和120d,两种反应体系上层的微生物群落紧密聚集...
他山石01 2020-06-04 02:53
版块工场 关于几种模型的解释教程
请问大家有没有RDA,PERMANOVA和PCoA三种模型的具体实际教程。有点晕
12茂茂34 2019-10-03 02:39
微生物 利用qPCR技术检测铜抗性基因PCOA,一般用什么引物比较合适
利用qPCR技术检测铜抗性基因PCOA,一般用什么引物比较合适天使托
紫尨星辰 2019-02-18 11:16
微生物 如何学习微生物群落分析和统计检验?
比如α多样性分析中的香农指数,辛普森指数,chao1指数等,β多样性分析中的PCA,PCoA等,还有相关的统计检验和关联分析。除了阅读文献,有没有相关的书籍或课程可以系统的学习?
dingtt15 2018-11-21 12:09
微生物 微生物群落结构测定
在做微生物群落结构的时候,会有PCoA,NMDS和OUT聚类分析,请问能确定是在门或者什么水平下测定的么?
张ms 2018-08-30 02:58
硕博家园 求助pcoa图的分析,谢谢
请问图1?学名叫什么呀?另,请问一下图2?pcoa图的分析,不太懂图中数据与实际的关系,谢谢。
YeahWtong 2018-08-24 08:23
论文投稿 审稿意见回复
土壤微生物中alphadiversity中PD,ACE,Chao1,ShannonIndex,Simperson他们都表示啥含义,之间有区别?附上审稿意见:...还有土壤微生物betadiversity用PCoA就能表示?谢谢大家!
qingyun9523 2018-08-18 01:11
分子生物 PCoA基本原理
有大神了解PCoA分析的基本原理和如何实现嘛?统计小白急求资料。
奇点_0826 2017-11-20 03:12
微生物 哪位大神能帮忙看看做PCoA代码中的问题
载入vegan包library(vegan)#读劝样本-物种”文件sp(file=file.choose(),sep="\t",header=T,row.names=1)sp#读劝样本-环境因子”文件se(file=file.choose(),sep="\t",header=T,row.names=1)...
机智的小神丶 2017-11-19 07:42
微生物 有谁知道PCoA主坐标分析图怎么看,横坐标是PC1,纵坐标是PC2
有谁知道PCoA主坐标分析图怎么看,横坐标是PC1,纵坐标是PC2
小忠忠么么 2017-08-15 06:13
分子生物 请问β多样性组间比较箱须图是用β多样性的什么数据画图呢?
请问我做了β多样性的分析包括PCOA、NMDs、以及距离矩阵,现在我需要做β多样性的组间差异分析,用箱须图表示,请问我该怎么做呢?
110147加油 2017-06-23 01:19
微生物 土壤微生物多样性分析-16S和ITS高通量测序
如题,我的课题是土壤...我的问题是后续分析中,PCoA图和NMDS图都会有加权和不加权的,文章中如果加权和不加权的图都放的话,怎么解释比较好,有相关的文章写得比较好的吗,可以推荐我看看。
lhf903 2017-02-15 10:17
金融投资 各位,求助r语言中pcoa结果的解释
各位大神,这是r语言中pcoa的结果,请问如何看取前几个坐标轴?累积贡献率有多大?谢谢!pcoa结果.png
tyndall 2016-12-04 12:30
硕博家园 qiime分析beta多样性
为什么我做出来的PCoA图是这样的啊,都没有标签(即哪种颜色哪种形状代表哪些样品)发自小木虫android客户端]...
ChengZQ 2016-11-22 12:21
硕博家园 代谢组学里的主成分分析法(PCoA),结果怎么看?
treatment.(a)PCoAplotdemonstratesstructuralchangesinmicrobialcommunitiesovertheperiodof7weeks,introducedbySFexposurefollowedby2weeksofsleeprecovery.The...
待望书 2016-11-07 12:48
论文投稿 the Interactive Plot Viewer在线检测是必须的吗?...
see:http://www.elsevier.com/interactiveplots.InteractivePlotsprovideeasyaccesstothedatabehindplots.Toincludeonewith...打算检测我的PCOA数据怎么设置啊,格式不知道如何
hanxinuo 2016-03-24 02:42
微生物 有谁知道canoco4.5怎么做PCoA主坐标分析吗?
找了很久都没有找到相关教程
sophia_p 2016-01-08 06:53
微生物 分子微生物生态学及环境基因组技术培训班
Pearsoncorrelation,(Partial)Manteltest2、排序分析:PCoA、NMDS、CCA3、方差分析:ANOVA、PERMANOVA、variancepartitioninganalysis(VPA)4、因果关系:Pathwayanalysis(PLS-PM)【收费...
zxy5139 2015-09-12 04:49
生物科学 QIIME-16s测序生物信息培训课程(原创)
PCoA分析,即主坐标分析(PCoA,PrincipalCoordinateAnalysis)可以从复杂的多维度数据中提取和可视化展示主要的高信息量突变,与PCA的主要思想类似。它将距离矩阵的信息转变成在一系列直交...
学员KgpCIM 2015-08-31 03:21
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