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分子微生物生态学及环境基因组技术培训班
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分子微生物生态学及环境基因组技术培训班 成都斯纳普生物科技有限公司联合中国科学院成都生物研究所于2015/11/7-11/8日举办《分子微生物生态学及环境基因组》技术培训班，欢迎全国生命科学、基础医学、农林科学等领域大专院校、科研机构、公司企业从事分子生物学、生物化学、遗传学、基因组学等研究、开发和教学的第一线研发人员和青年教师、博士后和高年级研究生参加。欢迎您报名参加！ 本次培训班主讲人均邀请具有实际的环境基因组和生物信息学的科研经验，培训过程中互动性强，理论与实际操作结合紧密，培训中可实际操作基本生物信息分析、个性化分析等上机操作。 主办单位：成都斯纳普生物科技有限公司 举办地：成都 培训时间：2015年11月7日-8日 成都站（报名中） 培训内容及安排： 日期 课程名称 课程内容 第一天 分子微生物生态学基础 1、物种进化的“三域学说” 2、群落结构与多样性 环境基因组技术基础 测序技术，生物信息学 测序技术原理及应用 1、以二代测序平台Illumina Miseq 2、同时介绍三代Pac Bio测序技术 Bioedit软件应用 NCBI Blast简介 1、Bioedit软件应用 2、NCBI Blast简介 高通量测序样品准备操作流程 1、生物样本采集 2、样本基因组DNA/RNA提取 3、高通量引物的选取 4、PCR扩增、产物回收及混样 5、建库及上机测序 利用Qiime平台处理测序数据 1、Qiime及相关软件介绍 2、FLASH软件进行序列拼接 3、去杂，提取barcoded序列，去除chimera，重取样 4、OTU及代表性序列的生成，物种分类 5、进化树构建 6、群落组成及结构差异分析 7、alpha多样性，beta多样性分析 提交序列到数据库 1、数据库介绍 2、提交序列到European Nucleotide Archive 第二天 宏基因组数据分析原理及平台介绍 宏基因组数据分析原理及平台介绍 MG-RAST平台分析宏基因组数据 1、物种组成及丰度分析 2、功能基因组成及分类分析 3、代谢通路分析 生态统计学方法培训 生态统计学方法培训 微生物菌群之间，以及微生物菌群与环境因子之间的相互关系分析 1、相关性分析：Pearson correlation, (Partial) Mantel test 2、排序分析：PCoA、NMDS、CCA 3、方差分析：ANOVA、PERMANOVA、variance partitioning analysis（VPA） 4、因果关系：Pathway analysis （PLS-PM） 【收费标准】 注册费：2500元/人，请自带笔记本电脑。 主办方可协助安排入住酒店，食宿费用自理 培训座位按收到报名表先后顺序安排。 【付费方式】现金、银行转账、银行汇款 单位全称：成都斯纳普生物科技有限公司 账号：4402256009100238131 开户银行：中国工商银行股份有限公司成都武侯祠支行 （汇款信息里 备注上：“您的姓名”） 【联系咨询】 电话：028-85100772，邮箱：2053490164@qq.com 张玉祥：18782059376，邮箱：64904709@qq.com 母桂谔：15196645188，邮箱：549897101@qq.com |
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