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毕设小白请教用MS的pdb文件借助VMD转成lammps的data文件的问题已有1人参与
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各位前辈好，我毕设是做一个分子动力学模拟，依照师姐的指导用MS建了模型然后导出pdb文件，再在VMD里打开 用 topo writelammpsdata xx.data charge命令来转data文件 建的模是纤锌矿结构的氧化锌，但是转出来的文件在电荷量那列全是0.00000 自己手动给改成了应该的2和-2后 运行lammps报错 format不对。。。。 紧急求教各位大神，这种情况如何能使VMD文件直接能导出带正确电荷值得的data文件（pbd文件和导出的data文件在附件里上传了） 感谢各位前辈的阅读 |
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欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：libolin3@tal.com - 附件 1 : ZnO5-5.pdb
- 附件 2 : ZnO.data
2015-05-08 16:07:07, 473.24 K
2015-05-08 16:07:19, 152.15 K
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赵红霞
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2楼2015-05-10 14:20:52
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