24小时热门版块排行榜    

查看: 1099  |  回复: 11
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

fly9810

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】轨道对称性部分出现很多问号!

请教一个关于对称性的问题:
   我用Gaussian优化富勒烯的一个结构(其最高对称性为D3h,但软件刚生成时的初始对称性为C1)。文献报道该结构的五重态能量最低且电子态为5A1',于是我把自旋多重度设置为5,对其进行几何优化并计算频率以及测试波函数稳定性(不限制其对称性,仍为C1,命令行未加nosymm)。计算完成后,得到其电子态为5A,对称性仍为C1,没有虚频且波函数也是稳定的。但用Gview看其对称性时发现:当前的点群为C1,但更高的点群的框里显示为D3h。于是我用Gview将其对称性提高到D3h,同样进行五重态的优化以及频率和波函数稳定性计算。结果这次算出的能量仅比上次的高0.003kcal/mol;高斯输出中,初猜的电子态为5A1',但下面的轨道对称性(即Orbital symmetries:下面的轨道对称性输出部分)里却有很多问号(?),接着是:Unable to determine electronic state:  an orbital has unidentified symmetry;这次仍没有虚频且波函数也稳定,高斯输出中对称性为D3h。
   请问接下来我应该如何处理呢?该结构的对称性到底是什么呢?D3h吗?那它的电子态又是什么呢?恳请大家帮忙!非常感谢!!!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fly9810

铜虫 (小有名气)

谢谢!

引用回帖:
Originally posted by wolfzhong at 2010-1-3 18:49:
电子态出现问号的情况非常多尤其是对含有3重轴的体系。
考虑这个问题基本出发点有以下2种:

1.你的体系是否真的具有这个对称性?
例如:Oh对称的某个分子因为John-Tayler畸变得到最终的D4h对称性。

2.体系 ...

多谢关注!
1. 有文献报道说,该结构不会发生John-Tayler畸变;
2. 1)您所说的“读小基组的轨道”,是指先用小的基组优化该结构并保存chk文件,若不破缺,再用大基组读取该chk文件,继续优化吗?
   2)"强制保持轨道及密度矩阵的对称性,dsymm” 是指在命令行中加入这样的命令吗: “opt dsymm” 。但实际上用Gview将其对称性提高到D3h再用高斯优化后,在输出文件中的对称性仍是D3h,不知您指的是什么意思?还望指点!多谢!
5楼2010-01-03 20:12:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fly9810

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
yjcmwgk(金币-5,VIP+0): 1-4 12:59
引用回帖:
Originally posted by wolfzhong at 2010-1-3 18:49:
电子态出现问号的情况非常多尤其是对含有3重轴的体系。
考虑这个问题基本出发点有以下2种:

1.你的体系是否真的具有这个对称性?
例如:Oh对称的某个分子因为John-Tayler畸变得到最终的D4h对称性。

2.体系 ...

不好意思,金币发完了!可我没权限再增加悬赏金币,劳烦版主再从我的金币中扣除5个给这位 wolfzhong  朋友,多谢!
6楼2010-01-03 20:20:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fly9810

铜虫 (小有名气)

测试结果!

引用回帖:
Originally posted by wolfzhong at 2010-1-3 22:25:
你这个体系是真具有D3h对称性(当然,也有可能别人报导的结果和你计算结果又偏差,但从你得到的结论看来不大可能),
1)就是取个结构,做个用小基组的单点,读小基组的chk,继续优化
2)保持结构是D3h对称性, ...

按照您所说的方法,我重新进行了一些测试计算,结果如下:

1)正如您所说,“对称性破却”确实是由所用基组增大引起,我用6-31G*和6-311G* 优化该结构时,都能得到电子态为5A1',且轨道对称性部分不出现问号,但当提高到6-311+G*时,又会出现问号,且Unable to determine electronic state:  an orbital has unidentified symmetry。

2)接下来我按您说的,我先用6-31G* 计算该结构的单点,然后用6-311+G* 读取以上的chk,继续优化(命令:geom=check guess=read opt),命令中不论加不加“scf=dsymm” ,最后结果均为:电子态:5A1;对称性(高斯输出中的)为C2v;轨道对称性部分不出现问号。

3)然后,我直接用6-31G* 优化该结构,接着用6-311+G* 读取其chk,继续优化(命令:geom=check guess=read opt scf=dsymm),或者直接用6-311+G* 优化该结构(opt scf=dsymm )。最后结果均为:电子态:5A1';对称性(高斯输出中的)为D3h;但轨道对称性部分都出现了问号。

4)所有上述用6-311+G* 基组优化得到的能量值以及上面发的帖子里的能量值都很接近,相差不到0.038kcal/mol,频率计算正在进行中,估计不会有虚频。

   现在的问题是:我能说该结构的对称性就是D3h吗?尽管轨道对称性部分的问号仍然没有消除。
10楼2010-01-05 11:24:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fly9810

铜虫 (小有名气)

谢谢哈!

引用回帖:
Originally posted by wolfzhong at 2010-1-5 12:00:
我的建议是使用sto-3g

还有你的c2v结构在loose的条件下就是d3h?

如果能正确判断电子态,问题不太大,
在轨道猜测时,肯定是只有那些小基组单点的轨道没有问题,因为基组加大的那些空轨道会问号,这没关系 ...

谢谢哈!

1. 我用sto-3g 算单点,用6-311+g* 读其chk并优化,发现单点计算部分中轨道中没有问号,对称性为D3h,电子态为5A1',但一进入下面的优化计算部分,对称性就变成了C2v(高斯输出中的结果),轨道部分没有问号,电子态还没算完,这跟用6-31g* 算单点再用6-311+g*优化时的情形是一样的。

2. 若在Gview中看C2v结构的对称性,在“更高的点群框”里显示的仍是D3h。

3. 用6-311+g* 优化完成后,所有带问号的轨道都分布在空轨道(包括Alpha Orbitals 和Beta  Orbitals)中,其中Alpha Orbitals共有80个占据轨道,487个空轨道(其中含有129个空轨道带问号),Beta  Orbitals共有76个占据轨道,491个空轨道(其中含126个带问号的空轨道)。

   实际上,用6-31g*基组优化该结构,精度已经足够了,而且对称性也是D3h,轨道部分不含问号,电子态也是5A1',能量最低,频率计算也没有虚频。后来又用6-311+g*优化,才出现了带问号轨道的情况。因此我认为该结构应该有D3h对称性。
12楼2010-01-05 17:17:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 fly9810 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[精细化工] 切削液交流群 +3 SZ吴彦祖 2024-06-17 3/150 2024-06-19 14:31 by herng2021
[论文投稿] 求机械类四区sci推荐 5+4 迷茫小旷 2024-06-14 5/250 2024-06-19 14:08 by tangjie12345
[基金申请] 2024国社科通讯评审 +19 qsd10086 2024-06-13 38/1900 2024-06-19 13:00 by lengyu345
[有机交流] 车间生产,真空度很高,温度很高,但减压蒸馏速度很慢。 10+13 召唤鬼泣lL 2024-06-13 39/1950 2024-06-19 11:26 by pengdatao
[基金申请] 江南大学到瑞士招聘,称取消非升即走,改预聘+长聘 +19 babu2015 2024-06-18 19/950 2024-06-19 10:16 by jonewore
[硕博家园] 关于硕博连读的一些疑问? +8 Lwenter 2024-06-14 10/500 2024-06-19 10:00 by qingdao001
[找工作] 药学硕士找不到工作,打算去做科研助理了 +8 pom戴墨镜 2024-06-14 21/1050 2024-06-19 08:43 by 兮兮235
[精细化工] 试剂价格 +4 旭必上岸 2024-06-17 4/200 2024-06-18 23:58 by 又幂青松顶
[基金申请] 希望今年自己国自然面上项目和老婆青年项目能中! +8 恐龙爸爸 2024-06-14 8/400 2024-06-18 19:57 by 3115321
[考博] 2025考博 +8 自强不息a?a 2024-06-15 13/650 2024-06-18 18:12 by 投必得科研顾问
[硕博家园] 博士毕业高校和就业的相关问题 +7 SCITOPPP 2024-06-14 11/550 2024-06-18 07:51 by yinxing1995
[基金申请] 面青地会评时间 +8 tanjydd 2024-06-15 8/400 2024-06-17 17:08 by 小龙虾2008
[基金申请] 博后面上今天有bug可以看到是否资助? +22 lyfbangong 2024-06-12 33/1650 2024-06-17 16:17 by carolloo
[教师之家] 每次骚扰女学生的都是院系领导,而不是普通教师,小编们要注意措辞正确 +9 zju2000 2024-06-15 11/550 2024-06-16 14:49 by appleapple2
[基金申请] 博后基金,博管会会提前知道消息吗? +4 yuyiang 2024-06-13 4/200 2024-06-16 11:40 by yangyuzhong4
[基金申请] 博后基金,以往的结果点不开,怎么回事呢?最后一次机会了,两次都没中前面。 +7 kyukitu 2024-06-14 13/650 2024-06-15 06:46 by 我是王小帅
[论文投稿] 投了一篇4区的SCI,审稿人一个拒稿,一个小修,编辑给了大修。 +9 安稳22123 2024-06-13 10/500 2024-06-14 23:45 by jurkat.1640
[基金申请] 工材E10口函评结束了吗 10+3 我1的飞翔 2024-06-13 5/250 2024-06-14 06:35 by nono2009
[论文投稿] 投稿后发现其他作者的邮箱填错了该怎么办呀 10+4 在飞的猪 2024-06-13 6/300 2024-06-14 04:45 by 小虫子咔咔
[考博] 博导选择 +3 bing85977 2024-06-12 3/150 2024-06-13 15:34 by 我是邱尧
信息提示
请填处理意见