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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps模拟聚合物使用amber力场如何设定力场参数和建立data文件
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莹儿的老牛

铜虫 (初入文坛)

[求助] lammps模拟聚合物使用amber力场如何设定力场参数和建立data文件已有1人参与

目前有人教我用msi2lmp建立data文件
但是这样子虽然能够得到键，角和二面角的信息
然而相关力场参数全都是0
最为关键的力场参数怎么设定呢？
求高手指教，先谢过了
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1楼2020-07-01 02:09:35
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
莹儿的老牛: 金币+1, ★★★很有帮助 2020-07-04 02:30:58
下载lammps的源程序，解压缩之后的文件夹里 lammps-3Mar20\tools\amber2lmp  内，amber2lammps.py 是一个把amber力场文件转换成lammps的data文件的工具，具体如何使用，请认真阅读  README  文件。
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2楼2020-07-03 09:29:54
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莹儿的老牛

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2020-07-03 09:29:54
下载lammps的源程序，解压缩之后的文件夹里 lammps-3Mar20\tools\amber2lmp  内，amber2lammps.py 是一个把amber力场文件转换成lammps的data文件的工具，具体如何使用，请认真阅读  README  文件。

非常感谢您的回答，不过我确实下载安装了lammps，却没有找到这个脚本……
实际上我下载了win版的LAMMPS-64bit-stable.exe
然而里边就没有tools这个文件夹……
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3楼2020-07-03 14:41:14
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
莹儿的老牛: 金币+1, ★有帮助 2020-07-08 02:26:47
引用回帖:
3楼: Originally posted by 莹儿的老牛 at 2020-07-03 14:41:14
非常感谢您的回答，不过我确实下载安装了lammps，却没有找到这个脚本……
实际上我下载了win版的LAMMPS-64bit-stable.exe
然而里边就没有tools这个文件夹……...

下载源程序包，lammps-stable.tar.gz
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4楼2020-07-07 21:07:04
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莹儿的老牛

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2020-07-07 21:07:04
下载源程序包，lammps-stable.tar.gz...

非常感谢您的回答，可惜还是没有解决问题
我看了一下这个脚本，脚本应该是将amber建立的结构文件转化成lammps的data文件
但是我不知道怎么用amber怎么建立这种结构文件……
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5楼2020-07-08 02:26:04
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