24小时热门版块排行榜    

查看: 2426  |  回复: 4
【悬赏金币】回答本帖问题,作者莹儿的老牛将赠送您 3 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

莹儿的老牛

铜虫 (初入文坛)

[求助] lammps模拟聚合物使用amber力场如何设定力场参数和建立data文件 已有1人参与

目前有人教我用msi2lmp建立data文件
但是这样子虽然能够得到键,角和二面角的信息
然而相关力场参数全都是0
最为关键的力场参数怎么设定呢?
求高手指教,先谢过了
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

莹儿的老牛

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2020-07-03 09:29:54
下载lammps的源程序,解压缩之后的文件夹里 lammps-3Mar20\tools\amber2lmp  内,amber2lammps.py 是一个把amber力场文件转换成lammps的data文件的工具,具体如何使用,请认真阅读  README  文件。

非常感谢您的回答,不过我确实下载安装了lammps,却没有找到这个脚本……
实际上我下载了win版的LAMMPS-64bit-stable.exe
然而里边就没有tools这个文件夹……
3楼2020-07-03 14:41:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
莹儿的老牛: 金币+1, ★★★很有帮助 2020-07-04 02:30:58
下载lammps的源程序,解压缩之后的文件夹里 lammps-3Mar20\tools\amber2lmp  内,amber2lammps.py 是一个把amber力场文件转换成lammps的data文件的工具,具体如何使用,请认真阅读  README  文件。
2楼2020-07-03 09:29:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖


莹儿的老牛: 金币+1, 有帮助 2020-07-08 02:26:47
引用回帖:
3楼: Originally posted by 莹儿的老牛 at 2020-07-03 14:41:14
非常感谢您的回答,不过我确实下载安装了lammps,却没有找到这个脚本……
实际上我下载了win版的LAMMPS-64bit-stable.exe
然而里边就没有tools这个文件夹……...

下载源程序包,lammps-stable.tar.gz
4楼2020-07-07 21:07:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +23 医学老男孩 2026-08-13 49/2450 2026-08-14 20:02 by zhaifei
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +6 启萌科技 2026-08-12 21/1050 2026-08-14 19:48 by 启萌科技
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-14 18:36 by 正能量1斤
[基金申请] filecode +6 cratir 2026-08-14 10/500 2026-08-14 18:29 by 笑叹辞穷
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[基金申请] 好奇怪的filecode +6 布布和一二 2026-08-08 7/350 2026-08-14 13:38 by Equinoxhua
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 12/600 2026-08-13 23:20 by iwuli
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
信息提示
请填处理意见