【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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莹儿的老牛

铜虫 (初入文坛)

[求助] lammps模拟聚合物使用amber力场如何设定力场参数和建立data文件已有1人参与

目前有人教我用msi2lmp建立data文件
但是这样子虽然能够得到键,角和二面角的信息
然而相关力场参数全都是0
最为关键的力场参数怎么设定呢?
求高手指教,先谢过了
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莹儿的老牛

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2020-07-03 09:29:54
下载lammps的源程序,解压缩之后的文件夹里 lammps-3Mar20\tools\amber2lmp  内,amber2lammps.py 是一个把amber力场文件转换成lammps的data文件的工具,具体如何使用,请认真阅读  README  文件。

非常感谢您的回答,不过我确实下载安装了lammps,却没有找到这个脚本……
实际上我下载了win版的LAMMPS-64bit-stable.exe
然而里边就没有tools这个文件夹……
3楼2020-07-03 14:41:14
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莹儿的老牛

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2020-07-07 21:07:04
下载源程序包,lammps-stable.tar.gz...

非常感谢您的回答,可惜还是没有解决问题
我看了一下这个脚本,脚本应该是将amber建立的结构文件转化成lammps的data文件
但是我不知道怎么用amber怎么建立这种结构文件……
5楼2020-07-08 02:26:04
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