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idoldog

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】听说NWCHEM巨慢无比,请问是否是这样的?

如题,Blyfes

[ Last edited by woshilsh on 2009-6-13 at 22:38 ]
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chrinide

木虫 (正式写手)

你的意思是指DFT analytic gradient or analytic hessian?

[ Last edited by chrinide on 2008-10-12 at 02:10 ]
未知必须借由更深的未知去获悉,隐晦必须借由更深的隐晦来明了
6楼2008-10-12 02:01:39
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

★ ★
mingdong(金币+2,VIP+0):谢谢! 4-9 06:37
NWChem是一只骆驼,你只有一根针。
要让骆驼穿过针眼,只比富人进天堂容易一点。

结论:你如果没有64个CPU,还是不要玩这个。
2楼2008-10-10 22:30:39
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

nwchem、gamess和gaussian的积分模块适合用Pople、Ahlrichs等人优化的分块收缩基组(如6-31g等),对20来个原子以下的体系,vtz基组级别的dft单点能计算,计算速度在一个量级,但没法准确说哪个更快,因为默认的数值积分精度、收敛精度等参数不一样,gaussian的默认设置相对来说是最粗糙的。但是对于更大的体系,采用几十个节点以上的并行计算,据说nwchem效率更高。

如果对纯GGA采用密度拟合基,gaussian要快很多。不过对于这种计算,要是换成adf,还会更快。

解析梯度结构优化:nwchem和gaussian的收敛都比较快,往往几步就能找到稳定构型。gamess慢得多。

dft解析频率计算也是gaussian的强项。gamess目前还不支持。nwchem的解析频率计算不能用对称性,如果要算C60一类的体系,一般的计算机根本做不了。不过据说nwchem以后的版本可以在频率计算加对称性,等着吧。

tddft(包括单点和结构优化,开壳层和闭壳层参考态):nwchem可以筛选感兴趣的态(比如只算允许跃迁的态),能大大降低计算量,gaussian和gamess似乎还没这个功能。
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2008-10-11 00:32:12
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chrinide

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by beefly at 2008-10-11 00:32:
nwchem、gamess和gaussian的积分模块适合用Pople、Ahlrichs等人优化的分块收缩基组(如6-31g等),对20来个原子以下的体系,vtz基组级别的dft单点能计算,计算速度在一个量级,但没法准确说哪个更快,因为默认的数 ...

我觉的你说的有误吧!? gamess支持dft的解析频率计算,速度很快,并且DDI并行的效率非常高(目前我测试过的量化软件里最高的了)!现在gamess还支持tddft的单点和结构优化,见http://www.msg.chem.iastate.edu/gamess/capabilities.html
另外gamess的MCSCF及CI引擎功能非常强大和高效,比gaussian及nwchem强好多,gamess独特的地方之一就是支持MCP,处理过渡金属能得到QZVP的精度。FMO和EFP也是gamess独特的功能,处理生物大分子时十分强大。nwchem的效率其实挺高(并行和单机),另外nwchem的TCE(张量收缩引擎)很强大!
从我做过的测试来看,gaussian算是最弱的了,只不过比较容易入手而已;gamess入手也容易,但要想深入,则需要很深的量子化学理论基础,因为很多参数需要自己去理解和把握;nwchem也一样,包罗万象,PW和PAW也都支持,且效率也相当不错!全能型选手!

[ Last edited by chrinide on 2008-10-11 at 11:14 ]
未知必须借由更深的未知去获悉,隐晦必须借由更深的隐晦来明了
4楼2008-10-11 10:23:35
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