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zlq5192021

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于RNA IP 试验中洗脱蛋白的问题 已有1人参与

最近一直很困惑,希望各位大牛指引

用生物素标记的RNA probe 做IP,用Promega的磁珠调取复合体,之后想要检测蛋白(直接western blot 或者 跑胶染色),蛋白应该怎么洗脱???

1、 有文章写到用biotin elution buffer洗脱 (12.5 mM biotin [Invitrogen], 7.5 mM HEPES [pH 7.5], 75 mM NaCl, 1.5 mM EDTA, 0.15% SDS, 0.075% sarkosyl, and 0.02% Na-Deoxycholate),之后用TCA进行纯化,但是我从生工买的 biotin很难溶解,invitrogen的又太贵,有没有好的建议?
2、考虑到前面要洗脱又要纯化等步骤,损失大,因为我只是要检测用,应该不需要蛋白活性,所以在想能不能直接用SDS-PAGE loading buffer 加到磁珠中直接洗脱蛋白,然后煮沸后上样????

在第二个问题上纠结很久了,自己有尝试做过,如果SDS-PAGE loading buffer 加到磁珠一起煮沸会有很多很亮的非特异带,不知道各位坛友大牛们有没有好的建议和见解?
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zlq5192021

新虫 (初入文坛)

2楼2016-02-26 11:44:55
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yanyanyuyu

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
也可以考虑使用50mM glycine, pH2.7作为洗脱液,某些抗体和Protein A的结合能力很强,在pH2.7时洗脱效果不太理想,可以使用50mM glycine, pH1.9作为洗脱液。
3楼2016-02-26 14:27:11
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