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温温水

新虫 (初入文坛)

[求助] Image J软件对纳米粒进行粒径统计并绘制三维图谱 已有1人参与

文献中看到有人用Image J软件对SEM的图片的纳米粒径进行统计分析,并绘制了三维图谱,本人看了很多Image J的教程,但还是不明白如何做出来的,希望知道的人指点一下。
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温温水

新虫 (初入文坛)

这是文献中的图
Image J软件对纳米粒进行粒径统计并绘制三维图谱
GKE@DAXR`0U)S7M64~2@M{N.jpg

2楼2016-02-24 10:05:20
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papaverme

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
图片看不太清楚,不过似乎这不是表达粒径分布的图吧
能给个原文链接吗?
3楼2016-02-24 10:19:15
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温温水

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by papaverme at 2016-02-24 10:19:15
图片看不太清楚,不过似乎这不是表达粒径分布的图吧
能给个原文链接吗?

http://xueshu.baidu.com/s?wd=paperuri%3A%2869dd61ab33533704cbaaf015d94b4c69%29&filter=sc_long_sign&sc_ks_para=q%3DTPGS2k%2FPLGA%20Nanoparticles%20for%20Overcoming%20Multidrug%20Resistance%20by%20Interfering%20Mitochondria%20of%20Human%20Alveolar%20Adenocarcinoma%20Cells.&tn=SE_baiduxueshu_c1gjeupa&ie=utf-8
4楼2016-02-24 12:28:31
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papaverme

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

原图也不太清楚。x和y坐标的单位看上去疑似inches,可能标尺校正有误。而z坐标没有单位,从数值上分析,疑似图像的8位灰度值。如果是这样,那么这个图像就是“3D Surface Plot”,在ImageJ的“Measure”菜单下能找到,你试试吧。
我复制粘贴原图进ImageJ,可以画出来几乎一样的图,除了xy的标尺。

如果确实是这样,这个图片就不对了。除了标尺校正的问题外,用SEM图像画“3D Surface Plot”从原理上就说不通。即使不考虑成分衬度、异常衬度等因素,SEM的图像中亮度值表示的是样品表面的倾斜程度而非高度,是不能简单地用“3D Surface Plot”画图的,即使是作为微分函数去求解,也存在解不唯一的问题。
5楼2016-02-24 14:42:23
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papaverme

铁杆木虫 (正式写手)

楼上所说的SEM图像,特指二次电子像(SE)。
应助帖不让编辑,在这里说明一下。
6楼2016-02-24 15:00:05
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温温水

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by papaverme at 2016-02-24 14:42:23
原图也不太清楚。x和y坐标的单位看上去疑似inches,可能标尺校正有误。而z坐标没有单位,从数值上分析,疑似图像的8位灰度值。如果是这样,那么这个图像就是“3D Surface Plot”,在ImageJ的“Measure”菜单下能找到 ...

单位可能是不对,因为Image J默认的单位为inches,作者可能忘记修改了,因为正文中提到的粒径的单位是nm。我在measure菜单下未找到3D Surface Plot,能否将你制图的过程分享一下。
7楼2016-02-24 21:09:43
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温温水

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by papaverme at 2016-02-24 15:00:05
楼上所说的SEM图像,特指二次电子像(SE)。
应助帖不让编辑,在这里说明一下。

文中提到的SEM(scanning electron microscope)是扫描电子显微镜的缩写,不知道和你说的是否同一概念。另外关于SEM图像中亮度值表示样品表面的倾斜程度而非高度,算是学习了,因为我并不懂。所以也不知道如何根据图像中的扫描电镜照片计算纳米粒粒径的。
8楼2016-02-24 21:13:44
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papaverme

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
温温水: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-02-24 22:39:43
1)imageJ里的功能跟你使用的版本有关,如果你的版本里找不到,可以单独下载安装这个插件。
这个功能下载地址为 http://imagej.net/plugins/downlo ... 3D_Surface_Plot.jar
介绍和说明参见 http://imagej.net/plugins/surface-plot-3d.html

2)从正文中看,这篇文章并没有用SEM来定量分析粒径分布,而真正用来做定量粒径分析的是动态光散射。作者从SEM得出的结论:一是颗粒为光滑球状,二是估计平均粒径在80-90nm左右,没有提及粒径分布的问题。图2的图注中说(b)是粒径分布,我认为是胡扯。实际上这个图(b)除了看起来花里胡哨以外,既没有起到任何作用,也不符合方法原理。

3)从SEM图像也可以做粒径分析,测量粒径,作出粒径分布。但不是这么干的。

4)也许总体说是不错的文章,但粗略看来这篇文章至少在SEM相关的部分错误不少,有些错误很低级,例如仪器型号,实验部分说用的是JEOL的JSM-5900,但图片上分明标注了是Hitachi的S-4800。拿这样的文章做榜样还是小心点吧。
9楼2016-02-24 22:00:11
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