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chengdon

新虫 (初入文坛)

[求助] 安捷伦2100检测chip实验富集到的DNA片段出现的倒峰是什么啊?

各位虫友,向大家请教一个chip方面的问题:
我在做chip实验超声破碎后,跑胶检测片段大小分布时,显示破碎后片段大小分布在250-1000之间,如下图:
但是,当我用抗体抓取我需要的目的片段后,反交联、纯化后,用安捷伦2100检测,发现:在目的片段大小范围没有特别陡峭的峰,且input组的条带大小分布较之实验组更加平缓,这与跑胶检测的结果矛盾,而且在300bp出出现了倒峰,如下图:
请问这是怎么回事啊?倒峰代表什么啊,杂质吗?还是我本身破碎的效果不好?又或者是在chip实验过程中没有纯化好?
希望大家帮我参考下,提供一点思路?
PS:我用的是普通的超声破碎仪。



安捷伦2100检测chip实验富集到的DNA片段出现的倒峰是什么啊?
安捷伦检测图(实验组)


安捷伦2100检测chip实验富集到的DNA片段出现的倒峰是什么啊?-1
超声破碎后,跑胶检测图.png


安捷伦2100检测chip实验富集到的DNA片段出现的倒峰是什么啊?-2
安捷伦检测图(input组【input组指没经过抗体孵育,是非特异性的片段。】)
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余献华

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 15103323277 at 2016-07-10 21:20:21
请问你这个超声破碎条件是什么啊

楼主,有结果了吗?
3楼2017-12-21 14:26:35
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15103323277

新虫 (初入文坛)

请问你这个超声破碎条件是什么啊
2楼2016-07-10 21:20:21
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