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安捷伦2100检测chip实验富集到的DNA片段出现的倒峰是什么啊？
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各位虫友，向大家请教一个chip方面的问题： 我在做chip实验超声破碎后，跑胶检测片段大小分布时，显示破碎后片段大小分布在250-1000之间，如下图： 但是，当我用抗体抓取我需要的目的片段后，反交联、纯化后，用安捷伦2100检测，发现：在目的片段大小范围没有特别陡峭的峰，且input组的条带大小分布较之实验组更加平缓，这与跑胶检测的结果矛盾，而且在300bp出出现了倒峰，如下图： 请问这是怎么回事啊？倒峰代表什么啊，杂质吗？还是我本身破碎的效果不好？又或者是在chip实验过程中没有纯化好？ 希望大家帮我参考下，提供一点思路？ PS：我用的是普通的超声破碎仪。   安捷伦检测图（实验组）  超声破碎后，跑胶检测图.png  安捷伦检测图（input组【input组指没经过抗体孵育，是非特异性的片段。】） |
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