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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » CSD下载的cif文件用MS画图氢原子太多是怎么回事？
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longwei1221

铁虫 (小有名气)

[求助] CSD下载的cif文件用MS画图氢原子太多是怎么回事？ 已有1人参与

如题。我在剑桥的CSD下载了SI型甲烷水合物的cif文件，但是用MS建模画图出来显示每个甲烷有12个氢原子，每个水分子则有4个氢原子，不知道怎么回事，如何理解啊？在线求解答！附上图和cif文件，红色的就是氧原子，四个角上就是甲烷分子，可见每个C原子对应12个H原子

CSD下载的cif文件用MS画图氢原子太多是怎么回事？
甲烷水合物的MS画图.png
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愿得一人心，白首不相离
1楼 2016-02-23 14:59:27
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11821973012

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
17楼: Originally posted by 柠檬爱苦茶 at 2017-03-21 19:35:22
自动加氢后，去掉对称性，再删除多余的原子就可以了！

则么确定要删的原子呢，对于这个晶体结构完全不懂

发自小木虫Android客户端
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19楼2017-03-21 23:21:57
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zyj8119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
longwei1221: 金币+20, ★有帮助, 那怎么解决这个问题呢？ 2016-02-28 07:45:51
你这个是因为衍射过程中晶体有对称性，导致衍射数据重复而生成的图。
赞一下(1人) 回复此楼
好好学习，天天向上。
2楼2016-02-24 14:25:26
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longwei1221

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zyj8119 at 2016-02-24 14:25:26
你这个是因为衍射过程中晶体有对称性，导致衍射数据重复而生成的图。

谢谢！那请问这个怎么解决呢？
赞一下 回复此楼
愿得一人心，白首不相离
3楼2016-02-28 07:45:17
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zyj8119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by longwei1221 at 2016-02-28 07:45:17
谢谢！那请问这个怎么解决呢？...

在MS里去掉对称性，自己慢慢删除。
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好好学习，天天向上。
4楼2016-02-28 19:40:02
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