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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » cif文件用MS画图氢分子太多，在线等求解
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longwei1221

铁虫 (小有名气)

[求助] cif文件用MS画图氢分子太多，在线等求解 已有2人参与

我用剑桥那个数据库下载了甲烷水合物的CIF文件，但是为何MS画图出来氢分子那么多呢？好像每个水分子都是有4个氢，每个甲烷分子貌似有12个氢，大家帮忙看看到底怎么回事吧，谢谢啦！在线等待中！

cif文件用MS画图氢分子太多，在线等求解
甲烷水合物的MS画图.png
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愿得一人心，白首不相离
1楼 2016-02-23 14:47:36
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longwei1221

铁虫 (小有名气)
那个图中红色是氧原子，八个角落的就是甲烷分子，但是每个碳原子对应有12个氢了，明显有问题。而每个红色的氧原子对应也有四个氢，不知道如何解释
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愿得一人心，白首不相离
2楼2016-02-23 14:48:51
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lintonlin332

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by longwei1221 at 2016-02-23 14:48:51
那个图中红色是氧原子，八个角落的就是甲烷分子，但是每个碳原子对应有12个氢了，明显有问题。而每个红色的氧原子对应也有四个氢，不知道如何解释

你要把文獻title and 出處貼出?戆伞＿@樣才有人幫到你

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3楼2016-02-24 02:57:31
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
longwei1221: 金币+15, ★有帮助, 这样做了还是不行，关键是没有成键 2016-02-28 07:46:43
内容已删除
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
4楼2016-02-24 09:11:48
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longwei1221

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 月只蓝 at 2016-02-24 09:11:48
自己下载的cif文件导入到MS中，首先要检查导入的晶体空间群是否正确。
经常遇到从数据库导出的cif文件，导入到MS中空间群错误的问题，使得导入的晶胞结构看起来不符合实际。
如果检查发现空间群错误，界面顶端Bui ...

我按照你说的去重新设置，我看空间群没有问题，应该还是cif文件里面氢原子本身多了，不知道为什么会这样，下载几个不同文献提供的cif文件都如此。而且还没有成键。我看到一个发表文章的建模就不是这样的。
cif文件用MS画图氢分子太多，在线等求解-1
甲烷水合物文献图.png
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愿得一人心，白首不相离
5楼2016-02-24 10:55:51
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爱在离别时hy

新虫 (初入文坛)
内容已删除
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6楼2017-03-03 13:56:46
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于知33

新虫 (初入文坛)
大神，我也对此感兴趣，可否把模型发我看看，十分感谢，谢谢啦！邮箱yufans33@163.com

发自小木虫Android客户端
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7楼2018-04-02 15:07:34
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