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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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mofashishe

铜虫 (小有名气)

[交流] 如何确定一个新基因的功能

分离到一个新基因,在NCBI上比对过,核苷酸和氨基酸都没有同源序列。

现在做了原位杂交确定了在哪些组织上表达和RNA干涉后大部分个体会出现死亡。

但这些都只是一些表形性状。

请问有什么办法能够确定这个基因究竟有什么功能,编码的蛋白是结构蛋白,还

是酶或者是有调控作用的多肽????
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shenye.judy

木虫 (正式写手)

应该有软件或网站预测蛋白质的结构域或信号肽之类的。是不是要做个过量表达看看?
2楼2008-10-10 10:36:39
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lipishun

金虫 (小有名气)

★ ★
司马诸葛(金币+2,VIP+0):谢谢交流 7-26 09:05
找相互作用的蛋白,看是否能和别的蛋白形成复合物,根据复合物里面的其他成员可以初步判断它在哪个领域起到作用。不知道你做的是哪个物种里面的基因。从你的表叙上看应该不是植物的。呵呵。可以通过缺失突变,研究其主要的结构功能域。因为大部分个体死亡?你确信就是RNAi干涉后的结果?如果那些没有死亡的个体,是由于RNAi没有发挥作用的结果,那么肯定这个基因对于个体是必需的。那就做做pull down或者IP之类的看看相互作用的蛋白,再确定其功能。这是我个人的意见....
3楼2008-10-10 11:17:00
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mofashishe

铜虫 (小有名气)

那请问怎么样找相互作用的蛋白呢??
4楼2008-10-10 13:32:07
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taishuai2004

做下QPCR或者酵母双杂交可以吗
我也不懂啊 学习中
5楼2008-10-10 16:42:28
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taishuai2004

有突变体吗?
6楼2008-10-10 16:43:24
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xenopus

木虫 (正式写手)

RNA干扰是不是应该控制在大部分不死亡,但是有phenotype啊?另外,也应该做做过量表达吧。也可以看看蛋白的亚细胞定位
7楼2008-10-11 11:24:06
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