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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 如何确定一个新基因的功能
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mofashishe

铜虫 (小有名气)

[交流] 如何确定一个新基因的功能

分离到一个新基因，在NCBI上比对过，核苷酸和氨基酸都没有同源序列。

现在做了原位杂交确定了在哪些组织上表达和RNA干涉后大部分个体会出现死亡。

但这些都只是一些表形性状。

请问有什么办法能够确定这个基因究竟有什么功能，编码的蛋白是结构蛋白，还

是酶或者是有调控作用的多肽????
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1楼 2008-10-09 22:42:09
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shenye.judy

木虫 (正式写手)
应该有软件或网站预测蛋白质的结构域或信号肽之类的。是不是要做个过量表达看看？
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2楼2008-10-10 10:36:39
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lipishun

金虫 (小有名气)
★ ★
司马诸葛(金币+2,VIP+0):谢谢交流 7-26 09:05
找相互作用的蛋白，看是否能和别的蛋白形成复合物，根据复合物里面的其他成员可以初步判断它在哪个领域起到作用。不知道你做的是哪个物种里面的基因。从你的表叙上看应该不是植物的。呵呵。可以通过缺失突变，研究其主要的结构功能域。因为大部分个体死亡？你确信就是RNAi干涉后的结果？如果那些没有死亡的个体，是由于RNAi没有发挥作用的结果，那么肯定这个基因对于个体是必需的。那就做做pull down或者IP之类的看看相互作用的蛋白，再确定其功能。这是我个人的意见....
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3楼2008-10-10 11:17:00
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mofashishe

铜虫 (小有名气)
那请问怎么样找相互作用的蛋白呢？？
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4楼2008-10-10 13:32:07
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taishuai2004

做下QPCR或者酵母双杂交可以吗
我也不懂啊 学习中
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5楼2008-10-10 16:42:28
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taishuai2004

有突变体吗？
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6楼2008-10-10 16:43:24
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xenopus

木虫 (正式写手)
RNA干扰是不是应该控制在大部分不死亡，但是有phenotype啊？另外，也应该做做过量表达吧。也可以看看蛋白的亚细胞定位
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7楼2008-10-11 11:24:06
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