| 查看: 2557 | 回复: 5 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
jinbei木虫 (正式写手)
|
[求助]
高斯09优化中途终止计算，log文件提示内存问题 已有1人参与
|
|
|
高斯09优化离子液体的结构时，计算到中途时出现问题，计算终止，输出文件.log文件（不是终端）里面最后一行出现“galloc: could not allocate memory.”这句号，计算到中途为何出现无法分配内存呢？ 之前由于输入文件“%mem=5500MW”内存设置为5500MW，优化时在终端出现“galloc: could not allocate memory.: Cannot allocate memory galloc”提示，此时，直接调整“%mem=4000MW”后即可正常运行。（服务器有32CPU，32G内存，红帽LINUX系统） （1）下面是输入文件.gjf的头几行（全部见附件）。 %nprocshared=2 %mem=4000MW %chk=05-Ps-mim_p-TSA_front_-opt-freq.chk # opt freq ub3lyp/6-311++g(d,p) pop=(nbo,savemixed) geom=connectivity （2）下面是输出文件.log的最后几行（全部见附件）。 Initial guess <Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 0.0000 <S**2>= 0.0000 S= 0.0000 Harris functional with IExCor= 402 diagonalized for initial guess. ExpMin= 3.60D-02 ExpMax= 9.34D+04 ExpMxC= 3.17D+03 IAcc=3 IRadAn= 0 AccDes= 0.00D+00 HarFok: IExCor= 402 AccDes= 0.00D+00 IRadAn= 0 IDoV= 1 ScaDFX= 1.000000 1.000000 1.000000 1.000000 FoFCou: FMM=F IPFlag= 0 FMFlag= 100000 FMFlg1= 0 NFxFlg= 0 DoJE=T BraDBF=F KetDBF=T FulRan=T Omega= 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 ICntrl= 500 IOpCl= 0 NMat0= 1 NMatS0= 1 NMatT0= 0 NMatD0= 1 NMtDS0= 0 NMtDT0= 0 I1Cent= 4 NGrid= 0. Petite list used in FoFCou. Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within 128 cycles. Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06. Requested convergence on energy=1.00D-06. No special actions if energy rises. SCF Done: E(UB3LYP) = -1903.00239220 A.U. after 14 cycles Convg = 0.3940D-08 -V/T = 2.0028 <Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 0.0000 <S**2>= 0.0000 S= 0.0000 <L.S>= 0.000000000000E+00 Annihilation of the first spin contaminant: S**2 before annihilation 0.0000, after 0.0000 DiagDN has N= 684 LTot= 2084 but NE2= 3 cannot use DSYEVD. Calling FoFJK, ICntrl= 2127 FMM=F ISym2X=0 I1Cent= 0 IOpClX= 1 NMat=1 NMatS=1 NMatT=0. galloc: could not allocate memory. |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 05-Ps-mim_p-TSA_front_-opt-freq-没有计算完.log
- 附件 2 : 05-Ps-mim_p-TSA_front_-opt-freq.gjf
2016-02-20 08:30:13, 4.94 M
2016-02-20 08:33:26, 7.68 K
» 猜你喜欢
分子动力学 Plumed教程求助
已经有0人回复
-
International Journal of Nanoscience属于中科院4区吗？
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有119人回复
-
研究生学术新锐奖｜宁波微纳材料研讨会参会通知
已经有2人回复
-
申请2027年材料/化学类博士
已经有6人回复
-
澳大利亚南昆士兰大学量子点课题组招收博士生
已经有0人回复
-
求相关合成条件
已经有12人回复
-
2027春季申博自荐
已经有6人回复
-
香港中文大学（深圳）2026年招聘公告
已经有0人回复
-
青基的材料青椒们，可以把硕士联培生送我这里，要研二男生
已经有61人回复
jinbei
木虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 6763.9
- 散金: 619
- 红花: 1
- 帖子: 391
- 在线: 1017.9小时
- 虫号: 258163
- 注册: 2006-06-10
- 性别: GG
- 专业: 金属有机化学
3楼2016-02-21 11:23:01
qchem
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 280 (大学生)
- 金币: 6871.6
- 散金: 1411
- 红花: 43
- 帖子: 2586
- 在线: 669.7小时
- 虫号: 183011
- 注册: 2006-02-12
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jinbei: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2016-02-21 20:08:46
感谢参与，应助指数 +1
jinbei: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2016-02-21 20:08:46
|
你算算32G等于多少MW就明白了 发自小木虫IOS客户端 |
2楼2016-02-21 08:26:39
qchem
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 280 (大学生)
- 金币: 6871.6
- 散金: 1411
- 红花: 43
- 帖子: 2586
- 在线: 669.7小时
- 虫号: 183011
- 注册: 2006-02-12
- 专业: 理论和计算化学
4楼2016-02-21 12:30:08
jinbei
木虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 6763.9
- 散金: 619
- 红花: 1
- 帖子: 391
- 在线: 1017.9小时
- 虫号: 258163
- 注册: 2006-06-10
- 性别: GG
- 专业: 金属有机化学
。 5楼2016-02-21 20:08:22
20