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jinbei木虫 (正式写手)
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高斯09优化中途终止计算，log文件提示内存问题 已有1人参与
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高斯09优化离子液体的结构时，计算到中途时出现问题，计算终止，输出文件.log文件（不是终端）里面最后一行出现“galloc: could not allocate memory.”这句号，计算到中途为何出现无法分配内存呢？ 之前由于输入文件“%mem=5500MW”内存设置为5500MW，优化时在终端出现“galloc: could not allocate memory.: Cannot allocate memory galloc”提示，此时，直接调整“%mem=4000MW”后即可正常运行。（服务器有32CPU，32G内存，红帽LINUX系统） （1）下面是输入文件.gjf的头几行（全部见附件）。 %nprocshared=2 %mem=4000MW %chk=05-Ps-mim_p-TSA_front_-opt-freq.chk # opt freq ub3lyp/6-311++g(d,p) pop=(nbo,savemixed) geom=connectivity （2）下面是输出文件.log的最后几行（全部见附件）。 Initial guess <Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 0.0000 <S**2>= 0.0000 S= 0.0000 Harris functional with IExCor= 402 diagonalized for initial guess. ExpMin= 3.60D-02 ExpMax= 9.34D+04 ExpMxC= 3.17D+03 IAcc=3 IRadAn= 0 AccDes= 0.00D+00 HarFok: IExCor= 402 AccDes= 0.00D+00 IRadAn= 0 IDoV= 1 ScaDFX= 1.000000 1.000000 1.000000 1.000000 FoFCou: FMM=F IPFlag= 0 FMFlag= 100000 FMFlg1= 0 NFxFlg= 0 DoJE=T BraDBF=F KetDBF=T FulRan=T Omega= 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 ICntrl= 500 IOpCl= 0 NMat0= 1 NMatS0= 1 NMatT0= 0 NMatD0= 1 NMtDS0= 0 NMtDT0= 0 I1Cent= 4 NGrid= 0. Petite list used in FoFCou. Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within 128 cycles. Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06. Requested convergence on energy=1.00D-06. No special actions if energy rises. SCF Done: E(UB3LYP) = -1903.00239220 A.U. after 14 cycles Convg = 0.3940D-08 -V/T = 2.0028 <Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 0.0000 <S**2>= 0.0000 S= 0.0000 <L.S>= 0.000000000000E+00 Annihilation of the first spin contaminant: S**2 before annihilation 0.0000, after 0.0000 DiagDN has N= 684 LTot= 2084 but NE2= 3 cannot use DSYEVD. Calling FoFJK, ICntrl= 2127 FMM=F ISym2X=0 I1Cent= 0 IOpClX= 1 NMat=1 NMatS=1 NMatT=0. galloc: could not allocate memory. |
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本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 05-Ps-mim_p-TSA_front_-opt-freq-没有计算完.log
- 附件 2 : 05-Ps-mim_p-TSA_front_-opt-freq.gjf
2016-02-20 08:30:13, 4.94 M
2016-02-20 08:33:26, 7.68 K
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你算算32G等于多少MW就明白了 发自小木虫IOS客户端 |
2楼2016-02-21 08:26:39
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