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不取俗名

木虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by dxyan at 2016-02-08 18:45:46
是的,我知道这样做,我之前算小分子是也是这样做的,我现在就是比较困惑的是,我无法判断我算出的单分子是个优化结构。因为双分子还好办些,其中可以估计可能的作用位点来摆放分子结构,从而进行不同可能初始结构 ...

没有虚频,4个yes可以基本算为判据

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11楼2016-02-08 18:47:06
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dxyan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 不取俗名 at 2016-02-08 18:36:30
你所说的通过能量和频率来查看是否会优化完毕,我不知道你说的是不是查看虚频,你之前的算的结构可能有虚频,如果你算的不是过度态,那这样的结果是不合理的,必须消除虚频
...

我以前是对不同可能的初始结构算能量和频率,算到没最后都没有虚频了。然后比较能量,选能量最低作为最优结构。现在去看那些选择的最优结构居然是4个NO。现在算的这个大分子一次就4个YES,但是构型和他人算的没双键的结构差异好大,我本以为结构应该差不多呢。
12楼2016-02-08 18:50:36
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dxyan

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
11楼: Originally posted by 不取俗名 at 2016-02-08 18:47:06
没有虚频,4个yes可以基本算为判据
...

好的,谢谢你耐心解答!春节快乐
13楼2016-02-08 18:53:04
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