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yezhonghua09

金虫 (正式写手)

[求助] 请教高斯View画图的难度 已有2人参与

图123是我在高斯View画的一个结构式,保存为gjf文件,然后打开后,发现中间的氧原子和对面的氢原子成键了;我手动改成不成键,保存后重新打开又成键了。
请问大神如何调整使得中间的氧原子和氢原子不成键,利用二面角工具好像不行,也可能是我接触高斯View不久的原因,不太会调整这样的构型。
谢谢!

请教高斯View画图的难度
123.png
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WANG7303

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yezhonghua09: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-02-03 01:05:38
你直接优化一下,氢键肯定就没了。
2楼2016-01-30 14:42:53
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jinbei

木虫 (正式写手)

直接更改氢和氧之间的键长,两者自动成键肯定是因为两者间距离短。

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-01-31 07:26:59
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yezhonghua09

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jinbei at 2016-01-31 07:26:59
直接更改氢和氧之间的键长,两者自动成键肯定是因为两者间距离短。

这样更改的话,对于S0的优化不会产生影响么?
谢谢
4楼2016-01-31 09:20:47
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yezhonghua09

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by WANG7303 at 2016-01-30 14:42:53
你直接优化一下,氢键肯定就没了。

您说的是我先S0进行优化一下,然后查看log文件,将没有氢键的结构保存为gjf,再次计算一下?
谢谢!
5楼2016-01-31 09:21:51
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WANG7303

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by yezhonghua09 at 2016-01-31 09:21:51
您说的是我先S0进行优化一下,然后查看log文件,将没有氢键的结构保存为gjf,再次计算一下?
谢谢!...

直接计算就可以了,没必要再次计算的。
6楼2016-02-01 15:00:15
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不取俗名

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yezhonghua09: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-02-03 01:05:51
view的显示是否成键,只是软件自己设置的阀值,与计算无关,另外,化学键本身系人为规定,并无实际意义,总之,无所谓

发自小木虫Android客户端
7楼2016-02-02 00:41:18
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