24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 4226  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

完全是火

铜虫 (小有名气)

[求助] 应当如何设置nvt nve npt 系综? 已有2人参与

比如 :
------------------------------------------------------------------
fix 1 all npt temp 2.5 2000 4.00 x 0.0 0.0 6.0 drag 0.2
run 100000
-------------------------------------------------------------------
2000是目标的温度,那前面的2.5是如何得来的?
计算的步数有什么要求没,是不是需要实时调整,如果到100000步还没达到2000k时是不是要继续计算下去?
如果达到了2000K应该要再保持多久?
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

完全是火

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by luftf at 2016-01-23 19:52:25
2.5是你自己定义的热浴初始温度
2000是你自己定义的热浴终止温度
将系统总能量随时间步的增长曲线输出,如果系统能量已经波动不大,说明弛豫效果较好,可以停止了

非常感谢您的回复,想再问您一下,热浴初始温度有什么要求没?
5楼2016-01-24 14:32:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

luzihen

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
fix里面的温度只是target温度,具体来说就是决定你热浴下动力学方程的那个参数.
打个比方
fix 1 all nvt temp 2.5 2000 4.00
run 100
那么这个时候第一步对应的热浴温度为2.5K,第一百部为2000K,中间线性插值
然而具体你的体系和这个热浴接触能到多少度就看你自己测试了,也许能热平衡,也许不能
调压得时候有的体系温度波动很大,比较难调温,比如一些amorphous相.

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2016-01-23 18:05:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luftf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
完全是火: 金币+25, ★★★★★最佳答案 2016-01-24 14:28:28
完全是火: 金币+25, ★★★★★最佳答案 2016-01-24 14:28:51
2.5是你自己定义的热浴初始温度
2000是你自己定义的热浴终止温度
将系统总能量随时间步的增长曲线输出,如果系统能量已经波动不大,说明弛豫效果较好,可以停止了
3楼2016-01-23 19:52:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

完全是火

铜虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by luzihen at 2016-01-23 18:05:59
fix里面的温度只是target温度,具体来说就是决定你热浴下动力学方程的那个参数.
打个比方
fix 1 all nvt temp 2.5 2000 4.00
run 100
那么这个时候第一步对应的热浴温度为2.5K,第一百部为2000K,中间线性插值
然 ...

非常感谢!
4楼2016-01-24 14:30:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化学070300 求调剂 +21 哈哈哈^_^ 2026-04-12 21/1050 2026-04-13 21:36 by nxybio2007
[考研] 一志愿哈工大 085600 277 12材科基求调剂 5+5 chenny174 2026-04-10 34/1700 2026-04-13 21:29 by 学员JpLReM
[考研] 材料工程281还有调剂机会吗 +33 xaw. 2026-04-11 34/1700 2026-04-13 21:23 by gretl
[基金申请] 有爆料,一个青年教师卖房得400万,然后换了一个四青帽子 +11 babu2015 2026-04-08 11/550 2026-04-13 16:33 by probebill
[考研] 0856专硕求调剂 希望是a区院校 +23 好好休息好不好 2026-04-09 26/1300 2026-04-13 14:22 by 张zhihao
[考研] 335求调剂 +18 想上岸呀!! 2026-04-12 19/950 2026-04-13 14:15 by 张zhihao
[考研] 22408 352分求调剂 +5 努力的夏末 2026-04-09 5/250 2026-04-12 19:17 by wj165256
[考研] 307求调剂 +10 tzq94092 2026-04-10 10/500 2026-04-12 08:18 by wise999
[考研] 一志愿郑州大学 22408 305分求调剂 +5 安小满zzz 2026-04-08 5/250 2026-04-12 00:41 by 蓝云思雨
[考研] 药学305求调剂 +8 玛卡巴卡boom 2026-04-10 8/400 2026-04-12 00:07 by zhouwenxian
[考研] 求调剂 +11 月@163.com 2026-04-07 13/650 2026-04-11 22:55 by BruceLiu320
[考研] 080100力学316求调剂 +8 L_Hairui 2026-04-07 8/400 2026-04-11 10:00 by zhq0425
[考研] 311求调剂 +13 xyp想读书 2026-04-10 14/700 2026-04-11 09:41 by 猪会飞
[考研] 本科西工大 324求调剂 +4 wysyjs25 2026-04-10 4/200 2026-04-10 20:00 by 来看流星雨10
[考研] 一志愿华东师范生物学326分,求调剂 +8 刘墨墨 2026-04-09 8/400 2026-04-10 12:00 by pengliang8036
[考博] 博士自荐 +7 可可小胖 2026-04-08 7/350 2026-04-10 08:28 by kimhero
[考研] 求调剂材料科学与工程一志愿985初试365分 +5 材化李可 2026-04-08 5/250 2026-04-09 17:00 by Lilly_Li
[考研] 086004 求调剂 309 +7 Yin DY 2026-04-08 7/350 2026-04-09 13:59 by Delta2012
[考研] 一志愿211,化学学硕,310分,本科重点双非,求调剂 +10 努力奋斗112 2026-04-07 10/500 2026-04-08 15:01 by screening
[考研] 材料调剂 +11 一样YWY 2026-04-07 11/550 2026-04-07 15:13 by shdgaomin
信息提示
请填处理意见