24小时热门版块排行榜    

查看: 4386  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

完全是火

铜虫 (小有名气)

[求助] 应当如何设置nvt nve npt 系综? 已有2人参与

比如 :
------------------------------------------------------------------
fix 1 all npt temp 2.5 2000 4.00 x 0.0 0.0 6.0 drag 0.2
run 100000
-------------------------------------------------------------------
2000是目标的温度,那前面的2.5是如何得来的?
计算的步数有什么要求没,是不是需要实时调整,如果到100000步还没达到2000k时是不是要继续计算下去?
如果达到了2000K应该要再保持多久?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

完全是火

铜虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by luzihen at 2016-01-23 18:05:59
fix里面的温度只是target温度,具体来说就是决定你热浴下动力学方程的那个参数.
打个比方
fix 1 all nvt temp 2.5 2000 4.00
run 100
那么这个时候第一步对应的热浴温度为2.5K,第一百部为2000K,中间线性插值
然 ...

非常感谢!
4楼2016-01-24 14:30:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

luzihen

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
fix里面的温度只是target温度,具体来说就是决定你热浴下动力学方程的那个参数.
打个比方
fix 1 all nvt temp 2.5 2000 4.00
run 100
那么这个时候第一步对应的热浴温度为2.5K,第一百部为2000K,中间线性插值
然而具体你的体系和这个热浴接触能到多少度就看你自己测试了,也许能热平衡,也许不能
调压得时候有的体系温度波动很大,比较难调温,比如一些amorphous相.

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2016-01-23 18:05:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luftf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
完全是火: 金币+25, ★★★★★最佳答案 2016-01-24 14:28:28
完全是火: 金币+25, ★★★★★最佳答案 2016-01-24 14:28:51
2.5是你自己定义的热浴初始温度
2000是你自己定义的热浴终止温度
将系统总能量随时间步的增长曲线输出,如果系统能量已经波动不大,说明弛豫效果较好,可以停止了
3楼2016-01-23 19:52:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

完全是火

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by luftf at 2016-01-23 19:52:25
2.5是你自己定义的热浴初始温度
2000是你自己定义的热浴终止温度
将系统总能量随时间步的增长曲线输出,如果系统能量已经波动不大,说明弛豫效果较好,可以停止了

非常感谢您的回复,想再问您一下,热浴初始温度有什么要求没?
5楼2016-01-24 14:32:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +3 爱看书的可乐 2026-08-08 3/150 2026-08-08 18:41 by imusthave
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +3 布布和一二 2026-08-08 3/150 2026-08-08 18:15 by Lightingo
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 5/250 2026-08-08 17:02 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:47 by oEVWOejN9taj
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:27 by oEVWOejN9taj
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:22 by oEVWOejN9taj
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 5/250 2026-08-08 15:59 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 WQyTGMbfH7Cx 2026-08-07 4/200 2026-08-08 15:02 by oEVWOejN9taj
[基金申请] fileCode有新解读? +9 Tide man 2026-08-08 17/850 2026-08-08 14:56 by archvillain
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:47 by oEVWOejN9taj
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 4/200 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:07 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:01 by oEVWOejN9taj
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 6/300 2026-08-08 10:19 by 3OOjAIS77qg2
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
信息提示
请填处理意见