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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » DNA重组 » 求问baised DNA 是什么意思
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lisaisacat

新虫 (小有名气)

[交流] 求问baised DNA 是什么意思

在做DNA片段化，看文献经常看到酶切方法会导致biased sequencing library，不明白是个什么概念，求指导，我是学化学的，不懂这个
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1楼 2016-01-22 09:01:56
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lifechuteng

新虫 (小有名气)
★
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意思就是测序文库的偏差，不平衡。
我的理解是测序文库中各个片段的含量理想状态下是相当的，但是用酶切的方法会导致文库中某些片段更容易被测序，而另外一些则不容易被测到。
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2楼2016-01-22 09:09:07
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jianguochen

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主应该说的是测序文库偏向性，文库打断的方法有多种，比如超声打断，酶切打断。酶切打断的时候，酶识别的位点在DNA上并不是完全随机分布，就会造成测序偏向性。
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lisaisacat
3楼2016-01-22 09:11:08
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lisaisacat

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by jianguochen at 2016-01-22 09:11:08
楼主应该说的是测序文库偏向性，文库打断的方法有多种，比如超声打断，酶切打断。酶切打断的时候，酶识别的位点在DNA上并不是完全随机分布，就会造成测序偏向性。

如果测序文库有偏向性会对测序造成什么影响呢？
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4楼2016-01-22 09:30:47
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jianguochen

新虫 (小有名气)
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引用回帖:
4楼: Originally posted by lisaisacat at 2016-01-22 09:30:47
如果测序文库有偏向性会对测序造成什么影响呢？...

会造成一些区域测序深度比其他区域低，不利于分析或者浪费数据；或者造成一些区域没有覆盖。
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5楼2016-01-25 09:46:02
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